Набор реагентов для качественного и количественного определения ДНК Mycoplasma genitalium методом ПЦР с детекцией в режиме "реального времени" (Amplitech MG) — инструкция и характеристики
Открытые закупки, где изделие проходит ТЗ
Сейчас открытых закупок, где изделие полностью проходит ТЗ, нет; список обновляется каждый день.
Построчная сверка ТЗ с характеристиками этого изделия и все закупки под ваши товары — в кабинете, 7 дней бесплатно.
Попробовать бесплатно
Текст инструкции: технические характеристики
--- стр. 2 --- 0 АМПЛИТЕК Amplitech MG Набор реагентов для качественного и количественного определения ДНК Mycoplasma genitalium методом ПЦР с детекцией в режиме «реального времени» (Amplitech MG) ИНСТРУКЦИЯ по ПРИМЕНЕНИЮ IVD REF РОЮ-О 96 --- стр. 3 --- ВВЕДЕНИЕ............................................................................................................................. 3 1 НАЗНАЧЕНИЕ........................................................................................................................4 1.1 Область применения........................................................................... 4 2 СОСТАВ...................................................................................................................................4 3 ПРИНЦИП МЕТОДА.............................................................................................................5 3.1 прослеживаемость значений положительного контроля ПК и............................5 4 НЕОБХОДИМОЕ ОБОРУДОВАНИЕ И МАТЕРИАЛЫ....................................................5 5 МЕРЫ ПРЕДОСТОРОЖНОСТИ........................................................................................6 6 ИССЛЕДУЕМЫЙ МАТЕРИАЛ..............................................................................................7 7 ПРОВЕДЕНИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ.....................................................................................9 7.1 Экстракция ДНК..............................................................................................................9 7.2 Подготовка к проведению ПЦР...................................................................................9 7.3 Проведение ПЦР и детекции.....................................................................................10 8 УЧЁТ И ИНТЕРПРЕТАЦИЯ РЕЗУЛЬТАТОВ .................................................................10 9 ВОЗМОЖНЫЕ ОШИБКИ...................................................................................................12 10 КОНТРОЛЬ КАЧЕСТВА..................................................................................................12 10.1 Контроли, используемые в процессе исследования ........................................12 10.2 Мониторинг лаборатории на наличие контаминации .......................................13 10.3 Внутренний контроль качества лабораторных исследований........................13 11 ФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ НАБОРА................................................13 11.1 Предел обнаружения...............................................................................................13 11.2 Диапазон измерения и предел измерения..........................................................13 11.3 Аналитическая специфичность..............................................................................13 11.4 Прецизионность измерения....................................................................................15 11.5 Правильность измерения .......................................................................................15 11.6 Диагностические характеристики..........................................................................15 11.7 Корреляция.................................................................................................................15 12 УСЛОВИЯ ХРАНЕНИЯ, ТРАНСПОРТИРОВАНИЯ И ЭКСПЛУАТАЦИИ НАБОРА ...........................................................................................................................................16 12.1 Срокгодности............................................................................................................16 12.2 Хранение....................................................................................................................16 12.3 Транспортирование.................................................................................................16 12.4 Эксплуатация............................................................................................................16 13 ПЕРЕЧЕНЬ СОКРАЩЕНИЙ...........................................................................................16 14 БИБЛИОГРАФИЯ.............................................................................................................17 15 ПЕРЕЧЕНЬ ПРИМЕНЯЕМЫХ НАЦИОНАЛЬНЫХ СТАНДАРТОВ.........................17 16 ГАРАНТИИ ПРОИЗВОДИТЕЛЯ....................................................................................18 17 ТЕХНИЧЕСКАЯ ПОДДЕРЖКА......................................................................................18 18 СИМВОЛЫ, ИСПОЛЬЗУЕМЫЕ В ДОКУМЕНТАЦИИ ПРОИЗВОДИТЕЛЯ ...........18 СОДЕРЖАНИЕ АтрН1есМ МО Инструкция В.26.08.22 --- стр. 4 --- 1. Настоящая инструкция по применению версии 26.08.22 распространяется на медицинское изделие «Набор реагентов для качественного и количественного определения ДНК Mycoplasma genitalium методом ПЦР с детекцией в режиме «реального времени» (Amplitech MG)» по ТУ 21.20.23-016-19926214-2022 (далее - набор). Краткое наименование набора; Amplitech MG. Набор следует применять в соответствии с действующей версией инструкции по применению. Для удобства работы в лаборатории допускается использовать действующую версию краткого руководства по применению набора. 2. Микроорганизм Mycoplasma genitalium является возбудителем инфекционно воспалительных заболеваний урогенитального тракта. Для данного микроорганизма отсутствуют специфические клинические признаки, на основании которых можно установить этиологию заболевания. ПЦР в реальном времени обладает высокой чувствительностью, специфичностью и объективностью полученных результатов [1]. Набор реагентов «Amplitech MG» позволяет выявлять и количественно измерять ДНК Mycoplasma genitalium. ВВЕДЕНИЕ Amplitech MG Инструкция в.26.08.22 --- стр. 5 --- щ Набор предназначен для качественного и количественного определения ДНК Mycoplasma genitalium в биологическом материале человека методом ПЦР с гибридизационно-флуоресцентной детекцией в режиме «реального времени». Материалом для проведения ПЦР-исследования служат образцы ДНК, экстрагированной из следующих видов биологического материала: • мазки со слизистой оболочки влагалища; • соскобы эпителия со слизистой оболочки цервикального канала, уретры; • секрет предстательной железы, моча (осадок первой порции утренней мочи). 1.1 Область применения Набор предназначен для применения в клинической лабораторной диагностике для исследования биологического материала, полученного от лиц с подозрением на наличие инфекций, передаваемых половым путём. Отрицательные результаты исследования с помощью набора не исключают возможность инфицирования М. genitalium и не должны использоваться в качестве единственной основы для принятия решения о лечении пациента. Отрицательные результаты исследования должны сочетаться с клиническими наблюдениями, историей болезни и эпидемиологической информацией. Набор может применяться в клинико-диагностических лабораториях. 1 НАЗНАЧЕНИЕ 2 СОСТАВ Состав набора^ указан в таблице 1. Состав набора Таблица 1 Компонент Номинальный объём« мл Кол-во Внешний вид Смесь-1 МО (Буферный раствор со специфическими праймерами, флуоресцентно-мечеными зондами и дНТФ) 0,48 1 пробирка Прозрачная жидкость от бесцветного до светло-голубого цвета Смесь-2 В (Буферный раствор с сульфатом магаия, термостабильной ДНК-полимеразой) 0,48 1 пробирка Прозрачная бесцветная жидкость вки (Раствор, содержащий генно-инженерную конструкцию с ДНК внутреннего контроля) 0,96 1 пробирка Прозрачная бесцветная жидкость ок (Буферный раствор) 0,8 1 пробирка Прозрачная бесцветная жидкость ПК и (Раствор, содержащий генно-инженерную конструкцию с фрагментом ДНК М. оепИаИит) 0,8 1 пробирка Прозрачная бесцветная жидкость В бумажном виде и электронном Инструкция по применению 1 шт. виде по адресу: Ьйр;//\лплпАг.атрН1есЬ.ги/ге8оигсе8/ Краткое руководство - 1 шт. В бумажном виде Паспорт - 1 шт. В электронном виде^ по адресу; http://www.amplitech.ru/qualitv/ ^ Набор упакован в полиэтиленовый пакет с застёжкой Zip-Lock. 2 В случае отсутствия доступа к Интернету обратитесь в службу технической поддержки по телефону (495) 374-13-46 для запроса о предоставлении бумажной версии паспорта. Amplitech MG Инструкция В.26.08.22 --- стр. 6 --- Набор рассчитан на проведение исследования 96 образцов, включая контроли. é 3 ПРИНЦИП МЕТОДА Исследование с помощью набора проводится методом ПЦР с гибридизационно- флуоресцентной детекцией продуктов амплификации в режиме «реального времени». Детекция продуктов ПЦР и раздельное выявление ДНК М. депИаНит и внутреннего контроля (ВК) обеспечивается применением в реакционной смеси для ПЦР флуоресцентно-меченых олигонуклеотидов, сигналы от которых регистрируются по различным каналам флуоресцентной детекции (см. таблицу 2). Таблица 2 Каналы детекции мишеней Канал детекции сигнала от флуорофора Мишень Область амплификации ROX ДНК М. genitalium pdhD gene Су5 ДНКВК Искусственно синтезированная последовательность Линейная зависимость между исходной концентрацией ДНК-мишени в исследуемом образце и циклом начала экспоненциального увеличения флуоресцентного сигнала (порогового цикла, Ct) позволяет определять концентрацию ДНК М. genitalium в образце относительно положительного контроля ПК U (образца с известной концентрацией ДНК-мишени), который проходит этап экстракции ДНК и ПЦР одновременно с исследуемыми образцами. Определение концентрации ДНК производится в соответствии с заданными значениями концентраций ПК U и полученными значениями Ct для ПК U и исследуемых образцов. 3.1 Прослеживаемость значений положительного контроля ПК U Концентрация клонированного фрагмента ДНК М. genitalium в ПК U составляет 5lg±0,5lg копий/мл. Концентрация определяется с помощью установленной производителем методики выполнения измерений на основе метода лимитирующих разведений [2, 3]. 4 НЕОБХОДИМОЕ ОБОРУДОВАНИЕ И МАТЕРИАЛЫ Для работы с набором требуются следующие оборудование и материалы: • ПЦР-бокс; • центрифуга-вортекс (РУ № ФС № 2005/518); • дозаторы переменного объёма, механические или электронные, с возможностью дозирования от 5 до 200 мкл (РУ № ФСР 2009/05681); • программируемый амплификатор с системой детекции флуоресцентного сигнала в режиме «реального времени» (ДТпрайм (ООО «НПО ДНК-Технология»; РУ № ФСЗ 2011/10229), CFX96 (Bio-Rad Laboratories, Inc.; РУ № ФСЗ 2008/03399), Applied Biosystems QuantStudio 5 (Life Technologies Holdings Pte. Ltd.; РУ № P3H 2019/8446), Rotor-Gene Q (QIAGEN GmbH; РУ № ФСЗ 2010/07595)); Amplitech MG Инструкция B.26.08.22 --- стр. 13 --- Таблица 9 Критерии оценки для контролей Контроль Норма ОК По каналу Суб значение С1 определено не больше граничного^. По каналу ROX значение С1 отсутствует. ПК и По каналам РОХ, Суб значение С1 определено не больше граничного. 9 ВОЗМОЖНЫЕ ОШИБКИ Рекомендации по устранению возможных ошибок, получаемых для исследуемых образцов и контролей в процессе исследования с помощью набора, указаны в таблице 10. Таблица 10 Рекомендации по устранению ошибок Ошибка Возможная причина возникновения Рекомендации по устранению Для ПК значение по каналу РОХ и/или Суб отсутствует или определено больше граничного^.____________ Некорректное проведение экстракции ДНК и/или ПЦР. Повторить исследование для всех образцов, начиная с этапа экстракции ДНК. Для ОК по каналу Суб значение С1 отсутствует или определено больше граничного._____________ Некорректное проведение экстракции ДНК и/или ПЦР. Повторить исследование для всех образцов, начиная с этапа экстракции ДНК. Для ОК по каналу РОХ определено значение С1. Контаминация реагентов или исследуемых образцов продуктами амплификации. Предпринять меры по выявлению и ликвидации источника контаминации и повторить исследование для всех образцов, начиная с этапа экстракции ДНК. 1 Невалидный результат для исследуемого образца (значение С1 по каналу Суб отсутствует или определено больше граничного, по каналу РОХ значение С1 отсутствуют). Некорректное проведение экстракции ДНК. Наличие в образце ингибиторов ПЦР. Повторить исследование данного исследуемого образца, начиная с этапа экстракции ДНК. В случае воспроизводимого результата рекомендуется повторное взятие и исследование биологического материала. 10 КОНТРОЛЬ КАЧЕСТВА 10.1 Контроля, используемые в процессе исследования Результаты исследования контролей должны соответствовать критериям оценки, указанным в разделе 8. 10.1.1 Отрицательный и положительный контроля Каждая группа экстрагируемых образцов должна включать контрольные образцы: • ОКдля выявления контаминации в процессе проведения исследования; • ПК и для контроля корректного прохождения исследования, а также для количественного определения ДНК М. genita!ium в биологическом материале человека. ^ Граничные значения С! указаны в кратком руководстве по применению набора. АтрП1есЬ МС Инструкция в.26.08.22 12 --- стр. 14 --- 4 10.1.2 Внутренний контроль Для контроля качества экстракции ДНК и оценки влияния ингибиторов на результаты амплификации используется экзогенный ВК, который добавляется на этапе экстракции ДНК в каждый исследуемый образец и контроли. Отсутствие результатов амплификации для ВК и одновременно для выявляемого микроорганизма свидетельствует о присутствии ингибиторов ПЦР в образце или некорректном проведении экстракции ДНК. 10.2 Мониторинг лаборатории на наличие контаминации Для выявления возможной контаминации лаборатории продуктами амплификации, исследуемыми и контрольными образцами рекомендуется раз в месяц исследовать смывы с рабочих поверхностей лабораторной мебели, оборудования и поверхностей помещений согласно процедуре, указанной в МУ 1.3.2569-09. При обнаружении контаминации необходимо провести мероприятия по её устранению согласно указаниям, описанным в МУ 1.3.2569-09. 10.3 Внутренний контроль качества лабораторных исследований Рекомендуется проводить контроль качества выполнения исследований с использованием панелей контрольных образцов, предназначенных для проведения внутреннего и внешнего контролей качества лабораторных исследований по обнаружению и количественному определению ДНК М. genitalium, либо сравнительным исследованием с использованием зарегистрированных в РФ наборов реагентов для качественного и количественного определения ДНК М. genitalium в биологическом материале методом ПЦР. 11 ФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ НАБОРА^ 11.1 Предел обнаружения Предел обнаружения набора составляет 800 ГЭ ДНК М. genitalium в 1 мл исследуемого материала (95 % ДИ: 466-1160 ГЭ/мл) для всех заявленных видов биологического материала. 11.2 Диапазон измерения и предел измерения Диапазон измерения составляет от 1600 до 100000000 ГЭ ДНК М. дет(аНит в 1 мл исследуемого материала для всех заявленных видов биологического материала. Предел измерения набора совпадает с нижней границей диапазона измерения набора. 11.3 Аналитическая специфичность Аналитическая специфичность набора оценивалась при тестировании микроорганизмов, указанных в таблице 11, геномной ДНК человека, а также ДНК ® Заявленные аналитические характеристики набора, кроме аналитической специфичности, проверены с использованием стандартного образца предприятия, содержащего вектор со специфической последовательностью ДНК М. депИаНит. Amplltech MG Инструкция В.26.08.22 13 --- стр. 15 --- ф М. дет(аНит. ДНК микроорганизмов в концентрации не менее 1-10® копий/мл и геномную ДНК человека в концентрации 1 мкг/мл вносили в образцы биологического материала, не содержащие ДНК М. дет(аНит. По итогам тестирования ложноположительных результатов выявлено не было. Таблица 11 Микроорганизмы, используемые для оценки аналитической специфичности Наименование Наименование Наименование Candida albicans Neisseria gonorrhoeae Trichomonas vaginalis Chlamydia trachomatis Neisseria flava Ureaplasma parvum Gardnerella vaginalis Staphylococcus aureus Ureaplasma urealyticum Enterococcus faecium Staphylococcus epidermidis CMV Escherichia coll Staphylococcus saprophyticus HSV 1 типа Lactobacillus spp. Toxoplasma gondii HSV 2 типа Mycoplasma hominis Treponema pallidum HPV 11.3.1 Потенциально интерферирующие вещества Потенциально интерферирующие вещества (ингибиторы ПЦР) и их максимальные концентрации в образце, для которых оценивалось их ингибирующее влияние на ПЦР, перечислены в таблице 12. Таблица 12 Потенциально интерферирующие вещества Исследуемый материал Интерферент Активный компонент Тип интерфе- ректа Концентрация вещества в образце Обоснование исследованной концентрации Мазки со слизистой оболочки влагалища, соскобы эпителия со слизистых оболочек цервикального канала, уретры Цельная кровь - Эндогенная 5 % V/V Муцин Очищенный белок субстанция 150 мкг/мл Объём в образце в условиях Моча(осадок Альбумин Белок Эндогенная субстанция 500 мг/л «наихудшего случая» первой порции) Азитромицин Азитромицин Антибиотик- азалид 1 мг/мл Секрет предстательной железы Фруктоза - Эндогенная субстанция 10 мг/мл И бу профен Ибупрофен НПВС 300 мкг/мл Наличие возможного ингибирующего эффекта оценивалось путём проведения процедуры экстракции ДНК^ из модельных образцов биологического материала, в которые добавлялись потенциальные интерференты в концентрациях согласно таблице 12 и стандартный образец предприятия, содержащий ДНК М. депИаНит в концентрации 2000 копий/мл. Далее с экстрагированными образцами проводили ПЦР с детекцией в режиме «реального времени» с использованием набора реагентов «АтрН1есЬ МС». ® Экстракция проводилась с использованием набора реагентов «ДНК-100» (ООО «Амплитек»), Атр1!1есЬ МО Инструкция в.26.08.22 14 --- стр. 16 --- в результате испытаний подтверждено, что влияние исследованных потенциально интерферирующих веществ на ПЦР, проводимую с использованием набора «АтрП1есЬ Мб», отсутствует. 11.4 Прецизионность измерения Коэффициент вариации повторяемости СУп значений концентрации, характеризующий внутрисерийную повторяемость измерений с использованием набора, не превышает 5 %. Коэффициент вариации воспроизводимости С\/в значений концентрации, характеризующий межсерийную воспроизводимость измерений с использованием набора, не превышает 10 %. 11.5 Правильность измерения Систематическая погрешность, характеризующая правильность измерения с использованием набора, не превышает 15 %. 11.6 Диагностические характеристики Значения диагностической чувствительности (ДЧ) и диагностической специфичности (ДС) набора с доверительной вероятностью 95 % указаны в таблице 13. Таблица 13 Диагностические характеристики Количество Исследуемый материал образцов дч,% дс,% положит. отрицат. Мазки со слизистой оболочки влагалища 100 103 97,0-100 97,1 -100 Соскобы эпителия со слизистой оболочки цервикального канала 105 100 97,2-100 97,0-100 Соскобы эпителия со слизистой оболочки уретры 103 101 97,1 -100 97,1-100 Моча (осадок первой порции) 100 100 97,0-100 97,0-100 Секрет предстательной железы 13 60 79,4-100 95,1-100 11.7 Корреляция Корреляция экспериментальных значений концентраций, полученных при исследовании образцов биологического материала с использованием набора реагентов «АтрН1есИ МО» и референтного набора реагентов, представлена на рисунке 1. Атр1КесЬ МО Инструкция в.26.08.22 15 --- стр. 17 --- 9,0 е 8,0 g:7.o 2 W )S 3.0 ьXШ ^0о.Q i О. 2 ,0 V«0,960e)( 4-0,2619 R * = a*2S 2,0 ^ 0 4,0 5,0 ^ 0 7,0 ^ 0 9,0 Amplitech MG, Ig ГЭ Рисунок 1 12 УСЛОВИЯ ХРАНЕНИЯ, ТРАНСПОРТИРОВАНИЯ И ЭКСПЛУАТАЦИИ НАБОРА 12.1 Срок годности Срок годности набора составляет 12 месяцев от даты изготовления. После вскрытия реагенты использовать до истечения срока годности набора. 12.2 Хранение Набор хранить при температуре от 2 X до 8 °С в защищённом от солнечного света месте. Реагенты после вскрытия хранить в тех же условиях, что и реагенты до вскрытия. 12.3 Транспортирование Набор транспортировать при температуре от 2 ®С до 8 ®С всеми видами крытых транспортных средств в термоконтейнерах с хладоэлементами или в авторефрижераторах. 12.4 Эксплуатация Реагенты, входящие в состав набора, готовы к использованию. Повторное применение использованных для исследования реагентов не допускается. Исследование образцов с использованием набора должно проводиться при температуре от 18 "С до 25 и относительной влажности воздуха от 25 % до 75 %. 13 ПЕРЕЧЕНЬ СОКРАЩЕНИЙ В настоящей инструкции применены следующие сокращения: Ct - cycle threshold (пороговый цикл) ВК - внутренний контроль ДИ - доверительный интервал ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота Amplitech MG Инструкция В.26.08.22 16 --- стр. 18 --- ДНКаза - дезоксирибонуклеаза OK - отрицательный контроль ПК - положительный контроль ПЦР - полимеразная цепная реакция 14 БИБЛИОГРАФИЯ 1. Гущин А.Е., Рыжих П.Г., Савочкина Ю.А., Шипулина О.Ю., Шипулин Г.А. Изучение распространенности возбудителей ИППП (С. trachomatis, N. gonorrhoeae, М. genitalium, Т. vaginalis) с помощью ПЦР в реальном времени в формате «МУЛЬТИПРАЙМ» // Клиническая дерматология и венерология. - 2011. - № 9(4). - С. 90-94. 2. Taswell С. Limiting dilution assays for the determination of immunocompetent cell frequencies // J. Immunology. - 1981. - Vol. 126. - P. 1614-1619. 3. Allen G. Rodrigo, Paul C. Goracke, Kiarash Rowhanian, James I. Mullins. Quantitation of target molecules from polymerase chain reaction-based limiting dilution assays //AIDS research and human retroviruses. - 1997. - Vol. 13 (9). - P. 737-742. 15 ПЕРЕЧЕНЬ ПРИМЕНЯЕМЫХ НАЦИОНАЛЬНЫХ СТАНДАРТОВ ГОСТ Р 51088-2013 Медицинские изделия для диагностики ин витро. Реагенты, наборы реагентов, тест-системы, контрольные материалы, питательные среды. Требования к изделиям и поддерживающей документации ГОСТ Р 51352-2013 Медицинские изделия для диагностики ин витро. Методы испытаний ГОСТ Р ИСО 18113-2-2015 Медицинские изделия для диагностики in vitro. Информация, предоставляемая изготовителем (маркировка). Часть 2. Реагенты для диагностики in vitro для профессионального применения ГОСТ Р ИСО 23640-2015 Изделия медицинские для диагностики in vitro. Оценка стабильности реагентов для диагностики in vitro ГОСТ Р ИСО 15223-1-2020 Изделия медицинские. Символы, применяемые при маркировании на медицинских изделиях, этикетках и в сопроводительной документации. Часть 1. Основные требования Amplltech MG Инструкция в.26.08.22 17 --- стр. 19 --- 16 ГАРАНТИИ ПРОИЗВОДИТЕЛЯ Производитель гарантирует соответствие характеристик набора требованиям, указанным в технической и эксплуатационной документации, в течение указанного срока годности при соблюдении условий его транспортирования, хранения и применения. Рекламации на качество набора направлять в адрес производителя: ООО «Амплитек», 109235, Москва, ул. 1-я Курьяновская, д. 34, стр. 8, этаж 1 пом. II ком. 42, тел. (495) 374-13-46, e-mail: support@amplitech.ru . Сообщения о неблагоприятных событиях (инцидентах), возникших при работе с набором и не указанных в данной инструкции, следует направлять производителю по указанному выше адресу и в уполномоченный регуляторный орган согласно действующему законодательству. 17 ТЕХНИЧЕСКАЯ ПОДДЕРЖКА Консультацию по вопросам по работе с набором и его качеству можно получить по контактам, указанным на официальном сайте производителя: www.amplitech.ru . 18 СИМВОЛЫ, ИСПОЛЬЗУЕМЫЕ В ДОКУМЕНТАЦИИ ПРОИЗВОДИТЕЛЯ M il IVD □а Изготовитель REF Дата изготовления Медицинское изделие для диагностики т уНю Обратитесь к инструкции по применению Содержимого достаточно для проведения п тестов LOT ж Номер по каталогу Код серии Использовать до Предел температуры Не допускать воздействия солнечного света У Общество с ограниченной ответственностью «Амплитек» (ООО «Амплитек»), Россия, 109235, Москва. ул. 1-я Курьяновская, д. 34, стр. 8, этаж 1 пом. II ком. 42 тел. (495) 374-13-46. www.amplitech.ru , e-mail: support@amplitech.ru Amplitech MG Инструкция в.26.08.22 18 --- стр. 20 --- Лист регистрации изменений Атр1КесЬ МО Инструкция 19