Набор Реагентов ONCO/Reveal Dx Lung and Colon Cancer Assay для выявления генетических мутаций, ассоциированных с раком легкого и раком прямой кишки методом секвенирования нового поколения — инструкция и характеристики
Открытые закупки, где изделие проходит ТЗ
Сейчас открытых закупок, где изделие полностью проходит ТЗ, нет; список обновляется каждый день.
Построчная сверка ТЗ с характеристиками этого изделия и все закупки под ваши товары — в кабинете, 7 дней бесплатно.
Попробовать бесплатно
Текст инструкции: технические характеристики
--- стр. 3 ---
N T
I oci ON(. () Rcvcul l)\ I 1ШЦ itiui I olon ( anccr Лs^av
НАИМЕНОВАНИЕ
Набор реагентов ONCO/Reveal Dx Lung and Colon Cancer Assay для выявления генетических
мутаций, ассоциированных с раком легкого и раком прямой кишки методом секвенирования
нового поколения (далее по тексту - набор реагентов ONCO/Reveal Dx Lung and Colon Cancer
Assay, ONCO/Reveal Dx Lung and Colon Cancer Assay (O/RDx-LCCA), O/RDx-LCCA, набор
реагентов, набор, тест, медицинское изделие).
НАЗНАЧЕНИЕ
Тест предназначен для выявления генетических вариантов (мутаций) в образцах ДНК,
выделенных из фиксированных в формалине и залитых в парафин образцов тканей (FFPE) рака
легких и колоректального рака. Этот тест предназначен для выявления генетических вариантов
(мутаций) в образцах ДНК пациентов с раком легких (NSCLC) и колоректальным раком (CRC),
что может послужить основанием для прогноза течения болезни, а также предсказания об
эффективности таргетной терапии лекарственными средствами (на основе актуальных
клинических рекомендаций). Набор может применяться для секвенирования на генетическом
секвенаторе MiSeqDx компании Иллюмина (lllumina). Используется для диагностики in vitro.
ПОКАЗАНИЯ К ПРИМЕНЕНИЮ
Тест ONCO/Reveal Dx Lung and Colon Cancer Assay (O/RDx-LCCA) на основе методов
секвенирования нового поколения предусмотрен для выявления соматических вариантов
(мутаций) в образцах ДНК, выделенных из фиксированных в формалине и залитых в парафин
образцов тканей (FFPE) рака легких (NSCLC) и колоректального рака (CRC). Этот тест
предназначен для выявления пациентов с раком легких или колоректальным раком, которые
могут получить лечение таргетными препаратами для назначения которых требуется
определение статуса указанных в таблице 1 мутаций в соответствии с инструкцией по
применению таких препаратов, назначаемых в соответствии с клиническими рекомендациями
для лечения соответствующих онкологических заболеваний, а также, в случае идентификации
вариантов, не указанных в таблице 1, для выбора и назначения терапии врачом
соответствующей квалификации в согласии с клиническими рекомендациями для лечения
соответствующих онкологических заболеваний. Набор может применяться для
секвенирования на генетическом секвенаторе MiSeqDx компании Иллюмина (lllumina).
Используется для диагностики in vitro.
Таблица 1 Список соматических вариантов, для которых требуется определение статуса
мутаций при назначении таргетной терапии в согласии с клиническими рекомендациями
Гни онкологии Ген Вариант
Колоректальный рак
(CRC)
KRAS KRAS дикого типа (отсутствие мутаций в кодонах 12 и 13)
Немелкоклеточный рак
легкого (NSCLC/НМРЛ)
EGFR Делении внутри рамки считывания в 19 экзоне
Мутации замены нуклеотидов L858R в 21 экзоне
Только для диагностики in vitro. Clpaiitma 2 иi 28 UM-0044, Редакция 4
--- стр. 4 ---
I ^ Л
• lO' ' N
Tcci ( )NC( )'Rcvcul l).\ I ling and ulon ( anccr \ssa>
Таблица 2 Варианты, для которых подтверждены только аналитические характеристики
Ген ID варианта Онкология
EGFR T790M NSCLC
EGFR G719A NSCLC
EGFR G719C NSCLC
EGFR G719D NSCLC
EGFR G719S NSCLC
EGFR Инсерции внутри рамки считывания в 20 экзоне NSCLC
BRAF V600E NSCLC
KRAS Мутации в 2 экзоне NSCLC
KRAS А59Е CRC
KRAS A59G CRC
KRAS А59Т CRC
KRAS A59S CRC
KRAS Q61E CRC
KRAS Q61H CRC
KRAS Q61K CRC
KRAS Q61L CRC
KRAS Q61R CRC
KRAS K117N CRC
KRAS А146Т CRC
KRAS А146Р CRC
KRAS A146V CRC
BRAF V600E CRC
ПРИНЦИП МЕТОДА
ОБЗОР
Набор реагентов ONCO/Reveal Dx Lung & Colon Cancer Assay позволяет подготавливать
образцы ДНК для секвенирования путем амплификации целевых областей ДНК, содержащих
мутационные «горячие точки», с использованием технологии SLIMamp™ (stem-loop inhibition
mediated amplification — подавление неспецифической амплификации посредством
образования шпилек). Секвенирование осуществляется на генетическом секвенаторе MiSeqDx,
также анализ и количественная оценка выявленных в образце генетических мутаций
(вариантов) и составление отчета о результатах выполняется программным обеспечением
PiVAT (Pillar Variant Analysis Toolkit), которое является собственностью компании Pillar
Bioscience.
ВЫДЕЛЕНИЕ И КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ОЦЕНКА ДНК ИЗ ОБРАЗЦОВ FFPE
После выделения ДНК проводится количественное определение концентрации геномной ДНК
из каждого образца фиксированных в формалине и залитых в парафин образцов тканей (FFPE)
для определения соответствия минимально необходимому для выполнения теста количеству
ДНК.
Только для диагностики in vitro. Cipaiimia 3 in 28 UM-0044, Редакция 4
--- стр. 5 ---
f h
■I !
Rl
1 cc i ( )NC () Rcvciil 1)\ 1 ting aiui ( olnii ( iiiuxT Assay
ПРИГОТОВЛЕНИЕ БИБЛИОТЕКИ
Ген-специфичная мультиплексная ПЦР (ГС-ПЦР) амплификация выполняется для обогащения
горячих точек (вариантов) образца геномной ДНК в одной пробирке. Продукты ген-
специфичной ПЦР очищаются и снова подвергаются амплификации с использованием
индексных праймеров, позволяющих образование кластеров в приборе MiSeqDx.
Индексированные библиотеки в дальнейщем проходят последовательные процессы очистки,
количественной оценки и нормализации для создания пула библиотек. Пул библиотек
используют для секвенирования по протоколу парных концевых последовательностей на
приборе MiSeqDx.
АНАЛИЗ ДАННБ1Х
Секвенирование запускается модулем п/о Pillar, сопряженным с п/о Local Run Manager (LRM)
lllumina. Результаты распознавания нуклеотидов при первичном анализе на приборе MiSeqDx,
демультиплексируются и разделяются на отдельные FASTQ файлы для каждого образца. Затем
результаты секвенирования вручную переносятся в п/о PiVAT для вторичного анализа.
Вторичный анализ включает выравнивание и сборку парных концевых последовательностей,
распознавание вариантов и составление отчета.
МАТЕРИАЛЫ И РЕАГЕНТЫ
НАБОР РЕАГЕНТОВ ONCO/Reveal Dx Lung and Colon Cancer Assay
ВНИМАНИЕ: набор(ы) реагентов ONCO/Reveal Dx Lung and Colon Cancer Assay при
получении следует распаковать и поместить на хранение при температуре, указанной в
Таблице 3.
Таблица 3 Реагенты, входящие в набор
К'ороГжа 1: реагенты для ГС-11ЦР: Количество Хранение
Мастер-микс для геноспецифической ПЦР (Gene-
Specific Master Mix)
1 пробирка (с красной
крышкой)
от-15 °С до -25 °С
Пул праймеров LC Oligo Pool 1 пробирка (с желтой крышкой) от-15°С до -25 °С
Положительный контроль (PosCtrl) 1 пробирка(с прозрачной
крышкой)
от-15°С до -25 °С
Урацил-ДНК-гликозилаза (UDG) 1 пробирка (с синей крышкой) от-15°С до -25 °С
Коробка Ли 2: ПЦР-реагенгы для
||нлекс 1 1рова 1 1ня
Ко.тчесгво Хранение
Мастер-микс для индексирования (Indexing PCR
Master Mix)
I пробирка(с зеленой
крышкой)
от-15°С до -25 °С
Прямые индексные праймеры (А501-А508) 8 пробирок (с белыми
крышками)
от-15°С до -25 °С
Обратные индексные праймеры (А701-А706) 6 пробирок (с оранжевыми
крышками)
от-15°С до -25 °С
Коробка Л*! 3: реагенгы для очистки ПЦР-
продуктов
Количество Хранение
Реагент для очистки продуктов ПЦР I флакон от 2 °С до 8 °С
Коробка Л1> 4: крышки для пробирок с
иидекснылт ii|)aiiMepa>iii
Количество Хранение
Белые крышки (для праймеров А501-А508) 24 крышки Комнатная температура (18-25
°С)
Только для диагностики in vitro. ripanniui 4 ш 2S UM-0044, Редакция 4
--- стр. 6 ---
m
I cci ONC'O'Kcvciil i)\ [ ung and Colon Caiic'cr \чча\
Оранжевые крышки (для праймеров А701-А706) 18 крышек Комнатная температура (18-25
°С)
Таблица 4 Необходимое программное обеспечение, входящее в набор
Оборудование П оста в щи к/ка тадожн ы й и ом ер
Программное обеспечение PiVAT Pillar Biosciences/SFW-2001
МАТЕРИАЛЫ И ОБОРУДОВАНИЕ
Таблица 5 Необходимые материалы, которые не входят в набор
Материал II оста вид и к/ката ложи ы й iio\iep
Реагенты для выделения и очистки ДНК Любой поставщик лабораторных материалов
См. ВЫДЕЛЕНИЕ ДНК
Набор реагентов MiSeqDx v3 (600 циклов) Illumina/20012552
Этанол, абсолютный (200 proof) для молекулярной
биологии
Любой поставщик лабораторных материалов
Вода очищенная, не содержащая нуклеаз Любой поставщик лабораторных материалов
Р-р Трис-НС1 10 ммоль/л с 0,1 % Твин-20, pH 8,5 Любой поставщик лабораторных материалов
10 н. раствор NaOH или 1 н. раствор NaOH Любой поставщик лабораторных материалов
Микроцентрифужные пробирки объемом 1,5 мл Любой поставщик лабораторных материалов
96-луночные ПЦР-планшеты, 0,2 мл Любой поставщик лабораторных материалов
Пленка для запечатывания микропланшетов Любой поставщик лабораторных материалов
Конические пробирки объемом 15 мл Любой поставщик лабораторных материалов
Конические пробирки объемом 50 мл Любой поставщик лабораторных материалов
Наконечники для микродозатора с фильтром (с защитой
против аэрозольных контаминаций)
Любой поставщик лабораторных материалов
Емкость для раствора (лоток или кювета) Любой поставщик лабораторных материалов
Таблица 6 Необходимое оборудование и программное обеспечение, которые не входят в набор
()Г)орулова1 1 1 1е Моставтик/каталожный номер
Прибор MiSeqDxf IlIumina/DX-410-1001
Сервер для установки ПО PiVAT Сервер любого производителя, соответствующий
следующими минимальным характеристикам:
• Intel Хеоп ЕЗ v5, или эквивалентный
• 6 ядер
• 32 Гб RAM
• 150 Гб на жестком диске
Спектрофотометр или флуориметр, обеспечивающий
измерение концентрации ДНК
Прибор любого производителя, соответствующий
следующим минимальным характеристикам: Объем
образца - не более 4 мкл
Вортекс Любой поставщик лабораторного оборудования
Магнитный штатив для 96-луночных планшетов Life Technologies/12331D или 12027, Beckman
Coulter/№ A32782 или аналог
Микроцентрифуга Любой поставщик лабораторного оборудования
TepMOHHiaiept с нагревающейся крышкой Любой поставщик лабораторного оборудования
Одноканальные и многоканальные микpoдoзaтopыt,
емкостью от 0,5 до 1000 мкл
Любой поставщик лабораторного оборудования
Только для диагностики in vitro. Clpanniia n ^ 2!S UM-0044, Редакция 4
--- стр. 7 ---
m
I cci ( )N C ( )'Rc\'cal I)\ I ипц and (. olon C anccr Л ^^ач
Центрифуга для ПЦР-планшетов Любой поставщик лабораторного оборудования
t Оборудование должно обслуживаться и/или калиброваться в соответствии с инструкциями производителя
Для выполнения протокола необходимы другие лабораторные принадлежности, такие, как
лабораторные перчатки, лед, кюветы для льда, стойки для пробирок и т.д. Для реагентов,
расходных материалов и оборудования, которые используются в помещениях для
подготовительных процедур, проведения ПЦР и последующих процедур (в «зоне до ПЦР»,
«зоне ПЦР» и «зоне после ПЦР») должны быть предусмотрены отдельные лабораторные
принадлежности (включая перчатки, лабораторные халаты и т. п.).
МЕРЫ ПРЕДОСТОРОЖНОСТИ И ТРЕБОВАНИЯ К ПРОВЕДЕНИЮ ПРОЦЕДУР
ОСОБЫЕ УКАЗАНИЯ И МЕРЫ ПРЕДОСТОРОЖНОСТИ
Пользователь должен придерживаться процедуры анализа и соблюдать меры
предосторожности при использовании набора реагентов ONCO/Reveal Dx Lung and Colon
Cancer Assay. __________________________________________________
• Набор ONCO/Reveal Dx Lung and Colon Cancer Assay предназначен исключительно для
диагностики in vitro.
Методика анализа была валидирована для ДНК, выделенной из FFPE образцов тканей
опухолей немелкоклеточного рака легких (NSCLC - НМРЛ) и колоректального рака (CRC
-КРР).
Не следует использовать реагенты после истечения срока годности или ненадлежащего
хранения.
Дополнительные особые указания, меры предосторожности и операции описаны в
инструкции по применению устройства MiSeqDx.
Для проведения анализа используются все реагенты, входящие в набор ONCO/Reveal Dx
Lung and Colon Cancer Assay. He следует заменять реагенты аналогами, так как это может
повлиять на результаты анализа.
Особое внимание следует уделить выполнению расчетов и переводу значений в
соответствующие единицы измерения.
Следует соблюдать меры предосторожности при загрузке образца и его дозировании, в
частности, при разведении.
На всех этапах рабочего процесса необходимо соблюдать меры предосторожности в
отнощении количественной оценки FFPE ДНК и подготовленных библиотек.
Использование плохо обслуживаемого и/или некалиброванного оборудования может
повлиять на результаты анализа.
При работе используйте средства индивидуальной защиты (защитную одежду, защитные
перчатки и маску).
НАДЛЕЖАЩАЯ ЛАБОРАТОРНАЯ ПРАКТИКА
1. Рабочие зоны: в целях снижения риска контаминации ПЦР-ампликонами не следует
перемещать материалы из одной рабочей зоны в другую. Для материалов,
предназначенных для использования в зоне ПЦР и зоне подготовительных процедур.
Только для диагностики in vitro. ripaiimia о на 2Х иМ-0044, Редакция 4
--- стр. 22 ---
m
PILLA'
R if ■= IFrvi: F
I cci ()N( ()'Rcvciil l)\ 1 img and ( ( ancer Assay
образом, чтобы основание картриджа было погружено до имеющейся на нем линии (water line).
Картридж не должен погружаться глубже этой линии.
2. Оставляют картридж с реактивами в водяной бане комнатной температуры (18-25 °С) до
полного размораживания, примерно на 1 час.
3. Извлекают картридж из водяной бани, устанавливают на поверхности стола и осторожно
постукивают, стряхивая капли воды. Насухо вытирают основание картриджа. Необходимо
убедится, что вода не попала на верхнюю часть картриджа.
4. Все оставшиеся капли воды удаляют безворсовой салфеткой.
Проверка картриджа
5. Переворачивают картридж десять раз, чтобы перемешать размороженные реагенты, и
проверяют, все ли реагенты оттаяли.
6. Проверяют реагенты в портах 1, 2 и 4, чтобы убедится, что они хорошо перемешаны и не
содержат преципитатов.
7. Осторожно постукивают картриджем по поверхности стола — это позволит уменьшить
количество пузырьков воздуха в реактивах.
8. Помещают картридж на лед или в холодильник с температурой 2 °С-8 °С (до 6 часов).
Подготовка реагентов для денатурации
9. Маркируют новую микроцентрифужную пробирку объемом 1,5 мл для 0,2 н. р-ра NaOH.
Вносят в пробирку 800 мкл очищенной воды, не содержащей нуклеаз, и 200 мкл 1,0 н. р-ра
NaOH. Перемешивают, переворачивая пробирку несколько раз.
10. В результате получают 1 мл 0,2 н. р-ра NaOH. Этот раствор можно использовать в течение
12 часов.
11. Извлекают НТ1 из морозильника (-15°С — 25°С) и размораживают при комнатной
температуре (18-25 °С). Хранят при температуре от 2°С до 8°С до разведения
денатурированных библиотек.
Денатурация пула библиотеки
12. Маркируют новую микроцентрифужную пробирку объемом 1,5 мл
денатурированной пула библиотеки.
13. Вносят в пробирку 5 мкл пула библиотеки и 5 мкл 0,2 н. р-ра NaOH.
14. Быстро перемешивают на вортексе и центрифугируют в течение 1 минуты.
15. Инкубируют 5 минут при комнатной температуре (18-25 °С).
для
Разведение деиатурировапиового пула библиотеки
16. Добавляют 990 мкл предварительно охлажденного реактива НТ1 в пробирку с
денатурированного пула библиотек.
17. Быстро перемешивают на вортексе и центрифугируют.
18. До начала этапа конечного разведения денатурированный пул библиотек помещают на
лед.
Только для диагностики in vitro. ('ipanmia 21 Hi 28 UM-0044, Редакция 4
--- стр. 23 ---
( Ь \ Aw
Ph -S riFK j- с;
Тсс I 0N('0'Reveal I)\ I ипц and Colon ( aneer \ssay
19. Маркируют новую микроцентрифужную пробирку объемом 1,5 мл для пула библиотеки,
предназначенной для загрузки в картридж с реактивами.
20. Объединяют 594 мкл денатурированной и разведенного пула библиотеки с 6 мкл
деионизированной воды.
21. Оставляют пробирку со смесью на льду до загрузки в картридж с реактивами.
СОЗДАНИЕ ЗАПУСКА ПРИ ПОМОЩИ ПРОГРАММЫ LOCAL RUN MANAGER
ВАЖНОЕ ПРИМЕЧАНИЕ
Валидированная методика анализа ONCO/Reveal Dx Lung and Colon Cancer Assay
подразумевает секвенирование на приборе Illumina MiSeqDx.
1. Для создания нового запуска необходимо выбрать команду «Create Run» (создать
запуск) на основной панели Local Run Manager. Страница создания запуска (Create Run)
включает следующие разделы:
• Название запуска (Run Name)
• Образцы (Samples)
2. Название запуска задается для идентификации запуска в процессе анализа. Название
может состоять из 40 буквенных/числовых символов. В названии можно использовать
пробелы, нижнее подчеркивание и косую черту.
3. Описание запуска вводится по желанию и может состоять из 150 буквенных/числовых
символов.
4. Характеристики исследуемых в запуске образцов указывают следующим образом:
Ввод информации об образцах вручцую
1. Используют пустую таблицу на экране «Create Run» (создать запуск).
2. В выпадающем списке выбирают количество образцов и набор индексных праймеров.
3. Вводят уникальное название библиотеки. В названии можно использовать
буквенные/числовые символы, пробелы и нижнее подчеркивание.
4. Положительный контроль или отрицательный контроль выбирают нажатием правой
кнопки мыщи, задавая тип контроля.
5. [Опционально] Выбирают функцию «Description» (описание) и вводят идентификатор
библиотеки. В названии можно использовать буквенные/числовые символы, пробелы и
нижнее подчеркивание. Положительный контроль или отрицательный контроль должны
быть заданы для каждой серии.
6. Из выпадающего списка выбирают «Index 1» (индексные праймеры 1) (17) и «Index 1
adapter» (адаптер 1 для индексных праймеров).
7. Из выпадающего списка выбирают «Index 2» (индексные праймеры 2) (15) и «Index 2
adapter» (адаптер 2 для индексных праймеров).
8. Выбирают опции просмотра, распечатки и сохранения схемы планшета для подготовки
библиотек:
• Для просмотра схемы планшета выбирают иконку «Print» (печать). Для вывода схемы
планшета на печать нажимают кнопку «Print» (печать).
• Для сохранения схемы планшета во внешнем файле выбирают опцию «Export» (экспорт).
9. Выбирают опцию «Save Run» (сохранить запуск)
Только для диагностики in vitro. ( Ipaiiniui 22 и ^ 28 UM-0044, Редакция 4
--- стр. 24 ---
m
P'L AR
IKN(
1 cci ONt'O'Rcvcal l)\ 1.ипц and ( oion ( anccr Assa\
И|ипорт информации об образцах
1. Выбирают опцию (щелкнув кнопкой мыши) импорта информации об образцах («Import
Samples») для выбора расположения файла с информацией об образцах. Можно
импортировать три типа файлов.
• Для создания новой схемы планшета нужно выбрать опцию «Template» (шаблон) на экране
«Create Run» (создать запуск). В файле с шаблоном содержаться сведения о правильных
заголовках полей для импорта. Вводят информацию обо всех образцах запуска в каждое поле.
Удаляют сведения, приведенные в качестве примера, из неиспользованных полей и
сохраняют файл.
• Используют файл с информацией об образце, который был экспортирован из модуля
анализа с помощью функции «Export» (экспорт).
• Загружают файл Pillar_sample_sheet_tool (таблицу для распределения образцов) с веб
сайта Pillar Biosciences или с рабочей станции PiVAT для создания новой схемы планшета.
Вводят необходимые данные и выбирают «Save to DESKTOP» (сохранить на рабочем столе).
2. Для просмотра схемы планшета выбирают иконку «Print» (печать).
3. Для вывода схемы планшета на печать нажимают кнопку «Print» (печать).
4. Выбирают опцию «Save Run» (сохранить запуск)
ЗАГРУЗКА БИБЛИОТЕК ОБРАЗЦА В КАРТРИДЖ
ВАЖНОЕ ПРИМЕЧАНИЕ
После полного размораживания и подготовки картриджа можно помещать в него образцы.
1. При помощи чистого пустого наконечника пипетки на 1 мл и прокалывают фольгу на
емкости картриджа с реактивами в позиции 17, маркированной «Load Samples» (загрузка
образцов). Примечание; на остальных емкостях с реактивами фольгу не прокалывают.
Фольга, закрывающая остальные емкости с реактивами, прокалывается в приборе
автоматически в процессе секвенирования.
2. Переносят дозатором 600 мкл подготовленной денатурированного пула библиотек в
емкость, маркированную «Load Samples» (загрузка образцов). Не следует касаться фольги.
3. После загрузки образца проверяют наличие пузырьков воздуха. Если имеются пузырьки
воздуха, следует осторожно постучать картриджем по поверхности стола, чтобы они исчезли.
4. Сразу после этого переходят к настройке запуска при помощи интерфейса операционного
программного обеспечения MiSeq Operating Software (MOS).
КОНФИГУРИРОВАНИЕ ЗАПУСКА
ВАЖНОЕ ПРИМЕЧАНИЕ
Полные инструкции по конфигурированию запуска прибора MiSeqDx приведены в
Справочном руководстве генетического секвенатора MiSeqDx для MOS v2 (документ #
1000000021961). _______________________________________________________________________
1. Выполняют вход в программу Local Run Manager прибора MiSeqDx , используя пароль.
2. На главном экране программного обеспечения MOS выбирают «Sequence»
(секвенирование).
3. Выбирают прогон из списка, затем опцию «Next» (следующее).
Только для диагностики in vitro. ( 'ipanmm 23 2К UM-0044, Редакция 4
--- стр. 27 ---
PIL' лк
BIO S' ir.’J f .
1 cci ()N( () Reveal l)\ 1 iing and Lolon ( aneer A,ssa\
ОГРАНИЧЕНИЯ
• Тест предназначен только для тканей указанных типов. Методика анализа ONCO/Reveal
Dx Lung and Colon Cancer Assay валидирована для исследования образцов тканей CRC и
NSCLC.
Тест ONCO/Reveal Dx Lung and Colon Cancer Assay предназначен для качественного анализа.
Результатом этого теста является выяснение наличия или отсутствия мутаций KRAS, EGFR и
BRAF, перечисленных в таблице 1 и таблице 2.
• Методика анализа ONCO/Reveal Dx Lung and Colon Cancer Assay была валидирована для
ДНК, выделенной из FFPE образцов тканей опухолей NSCLC и CRC.
• Эта валидированная методика подразумевает использование соответствующего набора
реагентов для количественной оценки ДНК, выделенной из FFPE образцов.
• Валидированная методика анализа ONCO/Reveal Dx Lung and Colon Cancer Assay
подразумевает секвенирование на приборе MiSeqDx.
• Процедуры теста должны выполнять только сотрудники, обладающие навыками
приготовления библиотеки для методик секвенирования нового поколения (Next-Generation
Sequencing) и навыками обращения с прибором MiSeqDx.
Тест ONCO/Reveal Dx Lung and Colon Cancer Assay предназначен для качественного анализа.
Результатом этого теста является выяснение наличия или отсутствия мутаций KRAS, EGFR и
BRAF, перечисленных в таблице 1 и таблице 2 раздела «Показания к применению».
• В образце ДНК, для которого получен результат теста “Варианты не выявлены”, могут
присутствовать другие варианты KRAS, EGFR и BRAF, не выявляемые этим тестом.
• Тест ONCO/Reveal Dx Lung and Colon Cancer Assay не должен использоваться для
постановки диагноза.
УСТРАНЕНИЕ ПРОБЛЕМ
Проблема Возможные причины Ретеиие
Низкий выход ген-
специфичного
продукта
Количество или качество
ДНК
Рекомендованное количество исходной геномной ДНК для
анализа составляет 10-80 нг. Для выделения ДНК может
потребоваться большее количество ткани FFPE, если образцы
FFPE имеют низкое качество.
Непроизводительная ПЦР Проверяют ПЦР протокол на соответствие надлежащему
протоколу ген-специфичной амплификации.
Низкая
эффективность
индексирования
Недостаточная очистка
Неполная очистка либо потеря ген-специфичных продуктов
могут повлиять на индексную ПЦР. Можно провести оценку
очищенных продуктов в агарозном геле, чтобы убедится в
отсутствии потерь.
На очистку ПЦР-продуктов влияет соотнощение
концентраций микрогранул и этанола. Убедитесь, что
используется надлежащая концентрация микрогранул для
очистки, а для промывки — свежеприготовленный 70 %
раствор этанола.
Этанол, оставщийся после промывки, может затруднять ПЦР.
После последнего этапа промывки удаляют остатки этанола
пипеткой, насколько возможно, и высушивают микрогранулы
до полного испарения этанола.
Непроизводительная ПЦР Проверяют протокол ПЦР на соответствие надлежащему
протоколу амплификации для индексирования.
Низкий выход
библиотеки
Количество или качество
ДНК
Рекомендованное количество исходной геномной ДНК для
анализа составляет 10-80 нг. Для выделения ДНК может
Только для диагностики in vitro. ('граница 2fi in 2S' UM-0044, Редакция 4
--- стр. 28 ---
rh
PILLAR
RIO" rol
led ()N(.'0'Rcvc;il I)\ l ung and C\)lon ( aiiccr Ass;i\
llpoO.ioia Возможные причины Решеиис
потребоваться большее количество ткани FFPE, если образцы
FFPE имеют низкое качество.
Для оценки выхода проводят проверку продуктов,
полученных в ген-специфичной ПЦР, в агарозном геле.
Проверку в агарозном геле можно провести также после
индексной ПЦР и до и после очистки микрогранулами.
Недостаточная очистка
Неполная очистка либо потеря продуктов могут повлиять на
конечный выход. Можно провести оценку очищенных
продуктов в агарозном геле, чтобы убедится в отсутствии
потерь при очистке.
На очистку ПЦР-продуктов влияет соотношение
концентраций микрогранул и этанола. Убедитесь, что
используется надлежащая концентрация микрогранул для
очистки, а для промывки — свежеприготовленный 70 %
раствор этанола.
Концентрация
нормализованных пулов
библиотек не равна 4
нмоль/л
Проверьте соответствие пула библиотек (Library Mix)
номинальной концентрациии 4 нмоль/л. При необходимости
разведите денатурированный пул библиотек (Library Mix) для
устранения различий концентрации.
Неудовлетворительное
качество библиотек
Неверная количественная оценка библиотеки может
приводить к артефактам в виде высокого или низкого выхода,
влияющим на последующую нормализацию.
Количественная оценка Проводят повторную количественную оценку конечных
библиотек и/или нормализованных библиотек на соответствие
ожидаемым значениям.
Недостаточная очистка
Изменение доли микрогранул для очистки влияет на очистку
продуктов. В частности, к чрезмерному кластерообразованию
может привести занижение значений общего количества,
вызванное присутствием димеров праймеров.
На очистку ПЦР-продуктов влияет соотнощение
концентраций микрогранул и этанола. Убедитесь, что
используется надлежащая концентрация микрогранул для
очистки, а для промывки — свежеприготовленный 70 %
раствор этанола.
Можно провести проверку на надлежащий размер продуктов и
наличие димеров в конечных библиотеках в агарозном геле.
Перекрестная
контаминация
Обязательно заменяйте наконечники дозаторов при работе с
разными образцами и не выполняйте манипуляций над
открытыми пробирками или планшетами. Соблюдайте меры
предосторожности при работе с жидкостями, и не проносите
использованные наконечники над образцами. Контаминация
соседних образцов может происходить, если емкости
неплотно закрыты или при наличии остатков растворов в
наконечниках дозаторов. Если возможно, лучше оставлять
между образцами пустые лунки.
Для предотвращения контаминаций ампликонами рабочие
пространства и принадлежности для процедур, проводимых до
и после ПЦР, должны быть разделены.
Рабочие поверхности, полы, оборудование и принадлежности
для работы следует периодически очищать специальным
раствором (10% р-р гипохлорита натрия, 70 % р-р
изопропанола или 70 % р-р этанола), удаляющим ампликоны с
Недостаточное или
избыточное
образование
кластеров библиотек
на приборе MiSeqDx
Присутствие
ампликонов в
отрицательном
контроле
Только для диагностики in vitro. Г граница 27 ш 2S иМ-0044, Редакция 4
--- стр. 29 ---
m
PI! -
RIO'" if;
I ecl ONC ()'Kcvcai l)\ i im u, and Colon C anccr As^av
ll|)o6.ic!\ia Возможные причины Решение
поверхностей.
Повторяют этап промывки (template line wash) секвенатора
MiSeqDx раствором гипохлорита натрия (NaOCl) согласно
инструкция по применению.
ОФИЦИАЛЬНАЯ ИНФОРМАЦИЯ
PiVAT®, SLIMamp®, Pillar® и ONCO/ReveaF''^ являются зарегистрированными или
ожидающими регистрации товарными знаками компании Pillar Biosciences, Inc. в США и/или
в других странах.
Illumina^''^ и MiSeqDx® являются зарегистрированными или ожидающими регистрации
товарными знаками компании «Иллюмина Инк.» (Illumina, Inc.) в США и/или в других странах.
ИНФОРМАЦИЯ О КОМПАНИИ
Pillar Biosciences, Inc.
9 Strathmore Road, Natick Massachusetts 01760, United States
techsupport@pillar-biosciences.com
https://pillar-biosciences.com/
Уполномоченный представитель в Европе: QAdvis EAR AB
Адрес уполномоченного представителя: Ideon Science Park, Scheelevagen 17, SE-223 70, Лунд,
Швеция (Lund, Sweden)
Данное руководство пользователя предназначено для Российской Федерации (РФ) и незначительно отличается от
руководства пользователя для Соединенных Штатов Америки (США), различия не затрагивают назначение и
принципов процедуры медицинского изделия.
Только для диагностики in vitro. C rpanniia 28 из 28 UM-0044, Редакция 4
--- стр. 33 ---
I cci ONC’O-Kcveeil I).x 1 uni: and ( olon ( anccr Assav
MaiepiiiKi Пропзводитель/Номер
pcnicTpaiiiioiiiioi О удосювсрснии
Вода очищенная, не содержащая нуклеаз Любой производитель лабораторных
материалов
Р-р Трис-НС1 10 ммоль/л с 0,1 % Твин-20, pH
8,5
Любой производитель лабораторных
материалов
10 н. раствор NaOH или 1 н. раствор NaOH Любой производитель лабораторных
материалов
Микроцентрифужные пробирки объемом 1,5 мл Любой производитель лабораторных
материалов, например:
Микропентрифужные пробирки 1,5 мл:
Посуда из полимерных материалов для
лабораторных исследований in vitro: 5.
Пробирки микроцентрифужные объемом
от 0,2 мл до 2,0 мл, с крышками и без
крышек, стерильные и нестерильные,
градуированные и неградуированные,
упакованные в пакеты и герметичные
коробки, РУ № ФСЗ 2011/10287 от
11.04.2017
96-луночные ПЦР-планшеты, 0,2 мл Любой производитель лабораторных
материалов, например: 96-луночные ПЦР-
планшеты, 0,2 мл:
Посуда из полимерных материалов для
лабораторных исследований in vitro: 12.
Планшеты для проведения полимеразной
цепной реакции (ПЦР-диагностики) на 6,
12, 24, 32, 48, 96 и 384 лунки, с объемом
лунки от 1,0 мкл до 2,2 мл, РУ № ФСЗ
2011/10287 от 11.04.2017
Пленка для запечатывания микропланшетов Любой производитель лабораторных
материалов, например: Посуда из
полимерных материалов для лабораторных
исследований in vitro: 14. Пленки
адгезивные для заклеивания ПЦР-
планшетов, РУ № ФСЗ 2011/10287 от
11.04.2017
Конические пробирки объемом 15 мл Любой производитель лабораторных
материалов, например:
Посуда из полимерных материалов для
лабораторных исследований in vitro 8.
Пробирки для хранения и
транспортировки проб и образцов,
завинчиваюшиеся, конические и с
основанием, с крышками и без крышек,
объемом от 0,5 мл до 50 мл, упакованные в
пакеты и штативы.
РУ № ФСЗ 2011/10287 от 11.04.2017
Конические пробирки объемом 50 мл Любой производитель лабораторных
материалов, например: Посуда из
--- стр. 34 ---
( h
Icci ()N( () Reveal l)\ I uni! and C olon C aneer As>av
MaicpiuKi П роизводт сл ь/Н 0!чер
рсгисграционною удос говерен 1П1
полимерных материалов для лабораторных
исследований in vitro 8. Пробирки для
хранения и транспортировки проб и
образцов, завинчивающиеся, конические и
с основанием, с крыщками и без крышек,
объемом от 0,5 мл до 50 мл, упакованные в
пакеты и щтативы.
РУ № ФСЗ 2011/10287 от 11.04.2017
Наконечники для микродозатора с фильтром (с
защитой против аэрозольных контаминаций)
Любой производитель лабораторных
материалов, например: Посуда из
полимерных материалов для лабораторных
исследований in vitro. 2. Наконечники
универсальные с фильтром, для
лабораторных дозаторов, объемом от 0,1
мкл до 10 мл, стерильные и нестерильные,
упакованные в пакеты и щтативы.
РУ № ФСЗ 2011 /10287 от 11.04.2017
Емкость для раствора (лоток или кювета) Любой производитель лабораторных
материалов, например: Емкость для
раствора (лоток или кювета):
Изделия медицинские полимерные для
лабораторных исследований in vitro
Резервуары для реагентов (вид 108740), РУ
№ ФСЗ 2009/05024 от 10.09.09
Таблица 2 Необходимое оборудование и программное обеспечение, которые не входят в
набор
Оборудование Пос 1 аBIIIHк'/катало'/кный номер
Прибор MiSeqDxt «Иллюмина, Инк.» (Illumina, Inc.), США
номер по каталогу DX-410-1001
Генетический секвенатор MiSeq в
вариантах исполнения: MiSeq, MiSeqDx,
РУ № РЗН 2014/1568 от 29.04.2014
Сервер для установки ПО PiVAT Сервер любого производителя,
соответствующий следующими
минимальным характеристикам:
• Intel Хеоп ЕЗ v5, или
эквивалентный
• 6 ядер
• 32 Гб RAM
• 150 Гб на жестком диске
Спектрофотометр или флуориметр. Прибор любого производителя.
обеспечивающий измерение конценрации ДНК соответствующий следующим
минимальным характеристикам: Объем
образца - не более 4 мкл
Вортекс Любой производитель лабораторного
оборудования, например: Вортекс
--- стр. 35 ---
( h
I cci ()N('U'Kevcal l)x I ипц and Colon ( ancor Assa\'
персональный V-1 plus, РУ № ФЗС
2011/09797 от 25.05.2011 г.
Магнитный штатив для 96-луночных планшетов Life Technologies Limited, Великобритания
или Beckman Coulter, Inc., США
Микроцентрифуга Любой производитель лабораторного
оборудования, например: Лабораторные
центрифуги MiniSpin, вариант исполнения:
MiniSpin. 11. Принадлежности: Ротор F-45-
12-11, РУ № ФСЗ 2012/13316 от 05.12.2012
г.
Термоциклер! с нагреваюшейся крышкой Любой производитель лабораторного
оборудования, например: Термоциклер для
амплификации нуклеиновых кислот 1000,
с принадлежностями
исполнение: С 1000, РУ № ФЗС
2008/03399 от 21.06.2016 г.
Одноканальные и многоканальные
микродозаторы!, емкостью от 0,5 до 1000 мкл
Любой производитель лабораторного
оборудования, например: Одно- и
многоканальные дозаторы ! от 0,5 до 1000
мкл:
Дозаторы пипеточные переменного объема
Eppendorf Research® Plus, вариант
исполнения: 1. Дозаторы механические
переменного объема одноканальные, РУ №
ФСЗ 2011/11028 от 15.11.2011 г.
Центрифуга для ПЦР-планшетов Любой производитель лабораторного
оборудования, например: Центрифуга
адаптированная для планшетов ПЦР:
Центрифуги лабораторные
многофункциональные серии 58 в
вариантах исполнения: 5804, 5804 R, 5810,
5810 R, с принадлежностями, РУ №» РЗН
2013/757 от 21.06.2013
t Оборудование должно обслуживаться и/или калиброваться в соответствии с инструкциями
производителя.
ИНФОРМАЦИЯ О МАТЕРИАЛАХ ДЛЯ ВЗЯТИЯ И ТРАНСПОРТИРОВКИ ОБРАЗЦА
ИЛИ ХАРАКТЕРИСТИКИ МАТЕРИАЛОВ, РЕКОМЕНДОВАННЫХ ДЛЯ ЭТИХ
ЦЕЛЕЙ.
МАТЕРИАЛОВ
Материалы не поставляются.
ИНФОРМАЦИЯ О НАЛИЧИИ В МЕДИЦИНСКОМ ИЗДЕЛИИ
ЖИВОТНОГО и (ИЛИ) ЧЕЛОВЕЧЕСКОГО ПРОИСХОЖДЕНИЯ ____________________
Не применимо. Набор не содержит материалов человеческого или животного происхождения.
ПЕРЕЧЕНЬ И ОПИСАНИЕ МАТЕРИАЛОВ МЕДИЦИНСКОГО ИЗДЕЛИЯ ДЛЯ
ДИАГНОСТИКИ IN VITRO, ВСТУПАЮЩИХ В КОНТАКТ С ТЕЛОМ ПАЦИЕНТА
(ТЕЛОМ ЧЕЛОВЕКА)
--- стр. 36 ---
fhI ■" If
cc i ()NC''( )'Revenl D \ I ипц and ( (don C dmccr Assa
He применимо. Медицинское изделие не контактирует ни прямо, ни косвенно с телом
пациента (телом человека). При проведении анализа персонал работает в защитной одежде,
защитных перчатках и маске.
БИОЛОГИЧЕСКИЙ РЕФЕРЕНТНЫЙ
МЕДИЦИНСКОГО ИЗДЕЛИЯ
ИНТЕРВАЛ ПРИМЕНЕНИЯ
Не применимо.
ИНФОРМАЦИЯ О ФАРМАЦЕВТИЧЕСКИХ СУБСТАНЦИЯХ, ИСПОЛЬЗУЕМЫХ
ДЛЯ КОНЕЧНОГО ПРОДУКТА, ВКЛЮЧАЯ ПРИНЦИПЫ И МЕТОДЫ ОЦЕНКИ
Не применимо. Не содержит фармацевтических субстанций.
МЕТОД ЗАКЛЮЧИТЕЛЬНОЙ СТЕРИЛИЗАЦИИ_____________________________________
Не применимо: не стерильно. Не подлежит стерилизации.
ИНФОРМАЦИЯ О РАНЕЕ ЗАРЕГИСТРИРОВАННЫХ ВЕРСИЯХ МЕДИЦИНСКОГО
ИЗДЕЛИЯ ____________________________________________________________________________
Другие версии ранее не были зарегистрированы в России.
СРОК годности
Срок годности Набор реагентов ONCO/Reveal Dx Lung and Colon Cancer Assay для выявления
генетических мутаций, ассоциированных с раком легкого и раком прямой кищки методом
секвенирования нового поколения составляет 13 месяцев.
УСЛОВИЯ ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЫ
Температура эксплуатации: 18-25 ° С.
Относительная влажность (RH): от 20 до 80% RH без конденсации
Давление: 101,5-71 кПа
УСЛОВИЯ ТРАНСПОРТИРОВКИ
ONCO/Reveal Dx Lung and Colon Cancer Assay можно транспортировать любым видом
транспорта в сухом льду.
Материалы и упаковка обеспечивают возможность использования теста ONCO/Reveal Dx
Lung and Colon Cancer Assay после транспортировки и хранения в соответствии с
рекомендациями, содержащимися в инструкции по применению.
При рекомендуемых условиях хранения набор стабилен в течение всего срока годности,
указанного на упаковке (Использовать до).
Относительная влажность (RH): от 20 до 80% RH без конденсации
Давление: 101,5-71 кПа
МАРКИРОВКА. СИМВОЛЫ И ОБОЗНАЧЕНИЯ
Список обозначений, используемых на маркировке:
Символ Значение
--- стр. 37 ---
( h
I ecl ()NC'( )'Kcvcai I).\ 1 iinu and Colon (. ancer /\ssav
РАБОЧИЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ МЕДИЦИНСКОГО ИЗДЕЛИЯ
Наименование Спецификация
характеристики
Тип Образца FFPE
Аналит ДНК
Диапазон ввода ДНК >10 нг
Биомаркеры, NSCLC - EGFR Exon 19 Del
имеющие значение NSCLC - EGFR L858R
для выбора таргетной CRC-KRASG12X
терапии согласно CRC-KRASG13X
--- стр. 38 ---
IFN F =
I cci ()N( ( b'K eveuI l)\ I unu Л1к1 C olon ( anccr Assav
клиническим
рекомендациям
Варианты
соматических
мутаций, для которых
подтверждены только
аналитические
характеристики
EGFR-T790M.(NSCLC)
EGFR-G719A.(NSCLC)
EGFR-G719C.(NSCLC)
EGFR-G719D.(NSCLC)
EGFR-G719S.(NSCLC)
EGFR-Инсерции внутри рамки считывания в 20 экзоне (NSCLC)
BRAF-V600E.(NSCLC)
KRAS-Мутации в 2 экзоне (NSCLC)KRAS-A59E.(CRC)
KRAS-A59G.(CRC)
KRAS-A59T.(CRC)
KRAS-A59S.(CRC)
KRAS-Q61E.(CRC)
KRAS-Q61H.(CRC)
KRAS-Q61K.(CRC)
KRAS-Q61L.(CRC)
KRAS-Q61R.(CRC)
KRAS-K117N.(CRC)
KRAS-A146T.(CRC)
KRAS-A146P.(CRC)
KRAS-A146V.(CRC)
BRAF-V600E.(CRC)
Все анализируемые
гены
AKTl ALK BRAF CTNNBl DDR2 EGFR ERBB2 ERBB4
FBXW7 FGFRl FGFR2 FGFR3 KRAS MAP2K1 MET NOTCH 1
NRAS PIK3CA PTEN SMAD4 STKl 1 TP53
Тип обнаруживаемых
генетических
вариантов
SNVs и InDels
Уровень
мультиплексирования
за прогон
<=48 проиндексированных библиотек
Чувствительность
РРА
99.4%
Специфичность
NPA
100%
Коэффициент
недействительных
результатов
1%
Предел обнаружения
мутантных аллелей
5%
Отсутствие мутаций в
отрицательном
контрольном образце
(NTC)
Глубина покрытия для всех целевых регионов ниже порога
покрытия
Положительный
контрольный образец
(PosCtrl)
Глубина покрытия для всех целевых регионов выше порога
покрытия
--- стр. 39 ---
m = ' ■ ■ i :
I cc! ()N(O'Kcvcal l)x I um i and C olon C anccr Assav
срок годности набора 13 месяцев
для анализа
ОПИСАНИЕ КОМПОНЕНТОВ МЕДИЦИНСКОГО ИЗДЕЛИЯ
Компонент Количество, объем, размеры Характеристики
I. Коробка 1: реагенты для ГС-ПЦР
Мастер-микс для
геноспецифической
ПЦР (Gene-Specific
Master Mix) - 1
пробирка(с
красной крышкой).
Количество: 1 пробирка
Объем реагента: 730 мкл ± 10 %
Масса: 2 г ± 10 %
Пробирка:
Высота: 4,5 см ± 10 %
Диаметр:! см ± 10 %
Крышка:
Высота: 0,6 см ± 10 %
Диаметр: 1,2 см ± 10 %
Назначение: смесь реагентов для
проведения ген-специфической
ПЦР.
Внешний вид: Прозрачная
бесцветная жидкость
Запах: без запаха
Пул праймеров LC
Oligo Pool - 1
пробирка (с желтой
крышкой)
Количество: 1 пробирка
Объем реагента: 290 мкл
Масса: 2 г ± 10 %
Пробирка:
Высота: 4,5 см ± 10 %
Диаметр:! см ± 10 %
Крышка:
Высота: 0,6 см ± 10 %
Диаметр: 1.2 см ± 10 %
Назначение: праймеры для
проведения ген-специфической
ПЦР
Внешний вид: Прозрачная
бесцветная жидкость
Запах: Слабый чесночный запах
Положительный
контроль (PosCtrl) -
1 пробирка(с
прозрачной
крышкой)
Количество: 1 пробирка
Объем реагента: 33 мкл ± 10 %
Масса: 2 г ± 10 %
Пробирка:
Высота: 4,5 см ± 10 %
Диаметр: 1 см ± 10 %
Крышка:
Высота: 0,6 см ± 10 %
Диаметр: 1,2 см ± 10 %
Назначение: положительный
контрольный образец (PosCtrl)
Внешний вид: Прозрачная
бесцветная жидкость
Запах: без запаха
Урацил-ДНК-
гликозилаза (UDG)
- 1 пробирка (с
синей крышкой)
Количество: 1 пробирка
Объемреагента: 58 мкл ± 10 %
Масса:2 г ± 10 %
Пробирка:
Высота: 4,5 см ± 10 %
Диаметр:! см ± 10 %
Крышка:
Высота: 0.6 см ± 10 %
Диаметр: 1,2 см ± 10 %
Назначение: фермент,
необходимый для проведения
ген-специфической ПЦР.
Внешний вид: Прозрачная
бесцветная жидкость
Запах: без запаха
II. Коробка 2: ПЦР-реагенты для индексирования
Мастер-микс для
индексирования
(Indexing PCR
Master Mix) - 1
Количество: 1 пробирка
Объем реагента: 1460 мкл ± 10 %
Масса: 2,2 г ± 10 %
Назначение: смесь реагентов для
проведения ПЦР,
обеспечивающая индексирование
библиотек ДНК
10
--- стр. 40 ---
m
I eci 0\C'() Kevciil I)\ I ипц .ind ( (don ( antfr Assa\'
пробирка(c
зеленой крышкой)
Пробирка:
Высота: 4,5 см ± 10 %
Диаметр:! см ± 10 %
Крышка:
Высота: 0,6 см ± 10 %
Диаметр: 1,2 см ± 10 %
Внешний вид: Прозрачная
бесцветная жидкость
Запах: без запаха
Прямые индексные
праймеры (А501-
А508)- 8 пробирок
(с белыми
крышками)
Количество: 8 пробирок
Объем реагента: 33 мкл ± 10 %
Масса: 1г ± 10 %
Пробирка:
Высота: 3,5 см ± 10 %
Диаметр: 0.8 см ± 10 %
Крышка:
Высота: 0,6 см ± 10 %
Диаметр: 0,9 см ± 10 %
Назначение: праймеры для
индексирования библиотек ДНК
Внешний вид: Прозрачная
бесцветная жидкость
Запах: без запаха
Обратные
индексные
праймеры (А701-
А706)- 6 пробирок
(с оранжевыми
крышками).
Количество: 6 пробирок
Объем реагента: 44 мкл
Масса: 1 г ± 10 %
Пробирка:
Высота: 3,5 см ± 10 %
Диаметр: 0,8 см ± 10 %
Крышка:
Высота: 0,6 см ± 10 %
Диаметр: 0,9 см ± 10 %
Назначение: праймеры для
индексирования библиотек ДНК
Внешний вид: Прозрачная
бесцветная жидкость
Запах: без запаха
III. Коробка 3: реагент для очистки ПЦР-продуктов
Реагент для
очистки продуктов
ПЦР - 1 флакон.
Количество: 1 флакон
Объемреагента: 6900 ± 10 %
Масса: 8 г ± 10 %
Пробирка:
Высота: 4,3 см ± 10 %
Диаметр: 2,0 см ± 10 %
Крышка:
Высота: 2,4 см ± 10 %
Диаметр: 1,4 см ± 10 %
Назначение: реагент
применяется для этапа очистки
продуктов ПЦР от компонентов
ПЦР смеси, таких как ферменты,
основания ДНК, соли
Внешний вид: Прозрачная
жидкость с коричневым осадком.
Запах: без запаха
Коробка 4: крышки для пробирок с индексными праймерами
Белые крышки (для
праймеров А501-
А508) - 24 крышки
Количество: 24 крышки
Масса:0,379 г ± 10 %
Высота: 1,4 см ± 10 %
Диаметр: 0.8 см ± 10 %
Назначение: крышки для
закрывания пробирок
Описание: белые крышки
Запах: н/п
Оранжевые
крышки (для
праймеров А701-
А706) - 18 крышек
Количество: 1 8 крышек
Масса: 0,379 г ± 10 %
Высота: 1,4 мм ± 10 %
Диаметр: 0,8 см ± 10 %
Назначение: крыш ки для
закрывания пробирок
Описание: оранжевые крышки
Запах: н/п
Программное обеспечение PiVAT на съемном носителе
Программное
обеспечение
PiVAT*
Количество: 1 твердотельный
накопитель
Толщина: 0,7 см ± Ю %
Назначение: Программное
обеспечение PiVAT
предназначено для анализа генов.
11
--- стр. 41 ---
Ifl
leci ()Ni('() Reveal I)\ I ипц ,iml Colon (. aneer Assas
Длина: 10 см ± 10 % ассоциированных с раком легкого
Ширина: 7 см ± 10 % и толстой кишки, методом
ONCO/Reveal Dx Lung and Colon
Cancer Assay. Pi VAT выполняет
вторичный анализ и создает отчет
по данным запусков
секвенирования для анализа
соотвтествующих генов.
Описание: Программное
обеспечение PiVAT на съемном
носителе
Запах: н/п
твердотельного накопителя.
ПЕРЕЧЕНЬ НАЦИОНАЛЬНЫХ И МЕЖДУНАРОДНЫХ ПРАВИЛ/СТАНДАРТОВ,
КОТОРЫМ СООТВЕТСТВУЕТ МЕДИЦИНСКОЕ ИЗДЕЛИЕ
Применимые
стандарты
Название
ISO
13485:2016/EN
ISO 13485:2016
Изделия медицинские. Системы менеджмента качества. Требования к
регулированию
EN ISO
14971:2012
Изделия медицинские. Применение менеджмента риска к
медицинским изделиям
EN ISO
23640:2015
Изделия медицинские для диагностики in vitro. Оценка стабильности
реагентов для диагностики in vitro
EN ISO 18113-
1:2011
Изделия медицинские для диагностики in vitro. Информация,
предоставляемая изготовителем
(маркировка). Часть 1. Термины, определения и общие требования
EN ISO 18113-
2:2009
Медицинские изделия для диагностики in vitro. Информация,
предоставляемая изготовителем (маркировка). Часть 2. Реагенты для
диагностики in vitro для профессионального применения
EN ISO 15223-
1:2016
Изделия медицинские. Символы, применяемые при маркировании на
медицинских изделиях, этикетках и в сопроводительной
документации. Часть 1. Основные требования
EN 13612:2002 Оценка функциональных характеристик медицинских изделий для
диагностики in vitro
EN 13975:2003 Методики выборочного контроля для приемочных испытаний
медицинских изделий для диагностики in vitro. Статистические
аспекты
EN 62366-1:2015 Изделия медицинские. Часть 1. Проектирование медицинских
изделий с учетом эксплуатационной пригодности
EN 62366-
2:2015
Изделия медицинские. Часть 2. Руководство по применению
проектирования с учетом эксплуатационной пригодности к
медицинским изделиям
lEC
62304/A 1:2006
Программное обеспечение для медицинских изделий - процессы
жизненного цикла программного обеспечения
SFS 1993:584 Шведский закон о медицинских изделиях для диагностики in vitro
12
--- стр. 42 ---
m
I cci ()N4 () Kc'vciil I )x [ iini! iin<.l C ('Ion C aiKcr Assav
LVFS 2001:7 Шведский закон о медицинских изделиях для диагностики in vitro
Регулирование: Директива IVD 98/79 / ЕС - Медицинские средства и оборудование для
лабораторной диагностики in vitro
РЕКЛАМАЦИЯ
Для получения технической консультации и поддержки просьба обращаться к
уполномоченному представителю производителя на территории Российской Федерации:
ООО "Р-ГЕН ПРОИЗВОДСТВО"
Россия, 119421, г. Москва, проспект Ленинский, д. 111, корпус 1, комната 99
Тел.: +7 (495) 956-79-37
Факс:+7 (495)956-79-38
E-mail: info@rpharm.ru
При возникновении побочных эффектов, не указанных в инструкции по применению или
руководстве пользователя медицинского изделия, нежелательных реакциях при его
использовании, особенностях взаимодействия медицинских изделий между собой, фактах и
обстоятельствах, представляющих угрозу для жизни и здоровья людей, здоровья граждан и
медицинских работников при применении и эксплуатации изделий медицинского назначения
необходимо отправить сообщение, содержащее указанную информацию, в Федеральную
службу по надзору в сфере здравоохранения в соответствии с действующим
законодательством.
ЗАЩИТА ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЫ
Во время работы и хранения медицинское изделие Набор реагентов ONCO/Reveal Dx Lung
and Colon Cancer Assay не оказывает отрицательного влияния на пациента, медицинских
работников и на окружающую среду при соблюдении правил, описанных в Руководстве по
эксплуатации.
УТИЛИЗАЦИЯ И УНИЧТОЖЕНИЕ
Утилизируйте использованные и неиспользованные реагенты и любые другие загрязненные
одноразовые материалы в соответствии с правилами утилизации инфицированных или
потенциально инфекционных продуктов.
Персонал лаборатории несет ответственность за обработку и удаление образующихся отходов
и сточных вод в соответствии с их типом и степенью опасности в соответствии со всеми
применимыми нормами и правилами.
Уничтожение продукции осуществляется организациями, имеющими соответствующую
лицензию, на специально оборудованных площадках, полигонах и помещениях в
соответствии с требованиями, предусмотренными действующими федеральными законами, и
с соблюдением обязательных требований по охране окружающей среды.
13
--- стр. 43 ---
m
C L ' i ()NC'()Kcvcal 1 ),\ i И П Ц ami ( olon ( an cL T Assii\
ТРЕБОВАНИЯ К РЕМОНТУ И ТЕХНИЧЕСКОМУ ОБСЛУЖИВАНИЮ
МЕДИЦИНСКОГО ИЗДЕЛИЯ __________________________________________
Не применимо.
РАЗРАБОТКА, ВЕРИФИКАЦИЯ И ВАЛИДАЦИЯ ПРОГРАММНОГО
ОБЕСПЕЧЕНИЯ______________________________________________________
Выполняются следующие тесты:
Категория Уровень
Определения проекта
Метод тестирования Деятельность
Проверка
кода
Код Рассмотрение Обзор программного
кода
Проверка
компонент
ов
Спецификация
разработки
программного
обеспечения
Модульное тестирование Проверка программного
модуля
SOUP Список Обзор и тестирование Проверка SOUP
Проверка
интеграции
Программная
архитектура и
требования к
программному
обеспечению
Тест Автоматическая
функциональная
проверка программного
обеспечения
Спецификация
разработки
программного
обеспечения
Тест Проверка программного
модуля
Архитектура
устройства и
требования к продукту
Обзор и тестирование Проверка набора
реагентов. Не требуется
для этого выпуска.
Проверка
системы
Требования к
программному
обеспечению
Тест Проверка требований к
программному
обеспечению
Требования к
программному
обеспечению
(показатели контроля
качества и варианты
отсечения)
Тест Проверка требований к
программному
обеспечению
Проверка новых
функций
программного
обеспечения
Тест Проверка требований к
программному
обеспечению
Требования к продукту Обзор и инспектирование Обзор маркировки
Зсе тесты пройдены успешно.
14
--- стр. 44 ---
(h
I се I ON( ()Keveal Dx 1 ипц and ( olon C .пкчт Assav
НАУЧНАЯ ЗНАЧИМОСТЬ АНАЛИТА
Колоректальный рак
Колоректальный рак (CRC) представляет собой серьезную проблему для здоровья, поскольку
это самый распространенный рак желудочно-кишечного тракта во всем мире, ежегодно
диагностируемый у более 1,2 миллиона человек'. Это третий по частоте диагноз рака как у
мужчин, так и у женщин^. Ежегодно в западном мире у более 520 000 человек впервые
диагностируется колоректальный рак'. Из всех диагностированных 35-50% умрут от
колоректального рака, что делает его второй ведущей причиной смерти от рака, поражающей
оба пола'"^. Лечебные подходы ограничены у значительной части пациентов, так как почти у
25% пациентов будет метастатическое заболевание, а у 40-50% тех, у кого изначально
диагностирована ранняя стадия заболевания, в конечном итоге разовьется метастатическое
заболевание^’ " ' .
Американский объединенный комитет по раку (AJCC) сообщает, что общая 5-летняя
выживаемость при колоректальном раке составляет 65,2% Ранняя стадия заболевания имеет
более благоприятный прогноз, и пациенты часто излечиваются только хирургической
резекцией. К сожалению, большинство пациентов с запущенным или метастатическим
заболеванием не подходят для резекции, и лечение является частью паллиативного, а не
лечебного подхода. В таких условиях цели лечения заключаются в замедлении
прогрессирования заболевания, продлении жизни и поддержании качества жизни.
Первая линия лечения
Хирургия, химиотерапия и лучевая терапия по-прежнему являются лечением первой линии
при первичных опухолях, но в значительной степени зависят от стадии заболевания -
адъювантная терапия обычно рекомендуется только при заболевании, прошедшем стадию II.
Количество и способы действия химиотерапевтических препаратов неуклонно увеличивались
на протяжении многих лет, и теперь в терапии первой линии используется фторпиримидин
(внутривенный 5-ФУ или пероральный капецитабин) в сочетании с оксалиплатином или
иринотеканом по различным схемам'^’'^ .
Генетическая вариация
Считается, что за онкогенез ответственны множественные критические гены и пути,
кодирующие белок. Колоректальные опухоли содержат в среднем 76 мутаций, в среднем 15
из которых затрагивают гены-кандидаты^’ * ^ . Более глубокое понимание генетических и
геномных изменений CRC помогло направить терапию и предсказать ответ, как показано для
пациентов с мутациями KRAS и BRAF^’'^ . Генетические и эпигенетические ошибки в путях
передачи сигналов приводят к злокачественным трансформациям и, таким образом,
становятся ключевыми кандидатами для молекулярно-направленной терапии".
Лечение рака прямой кишки
Существует восемь одобренных Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых
продуктов и медикаментов (FDA) таргетных методов лечения метастатического CRC:
крупномолекулярные моноклональные антитела (шАЬ) (бевацизумаб, цетуксимаб,
ниволумаб, нанитумумаб и рамуцирумаб), рекомбинантный фьюжн белок (зив-афлиберцент),
а также низкомолекулярный ингибитор (регорафениб) и аналоги нуклеозидов (трифлуридин
/ типирацил) Из них бевацизумаб, рамуцирумаб и зив-афлиберцепт нацелены на
неоангиогенез за счет ингибирования фактора роста эндотелия сосудов (VEGF). Несмотря на
то, что резистентность к ингибиторам VEGF известна, на сегодняшний день клинически
значимых биомаркеров не установлено.
Лекарства цетуксимаб и нанитумумаб нацелены на рецептор эпидермального фактора роста
(EGFR), клеточный поверхностный рецептор эпидермального фактора роста, молекула.
15
--- стр. 50 ---
m
Tcci O N C () Reveal l)x I ипц and ( olon C aneer Assay
55. Kim D, Mehra R, Tan DS-W, Felip E, Chow LQM, Camidge DR, et al., edi- tors. Ceritinib
in Advanced Anaplastic Lymphoma Kinase (ALK)-Rearranged (ALK+) Non-Small Cell Lung
Cancer (NSCLC): Results of the ASCEND-1 Trial. Chicago: ASCO (2014).
56. Felip E, Kim D, Mehra R, Tan DSW, Chow LQ, Camidge DR, et al., editors. Efficacy and
safety of ceritinib in patients (pts) with advanced anaplastic lymphoma kinase (ALK)- rearranged
(ALK+) non-small cell lung cancer (NSCLC). Ann Oncol (2014) 25(Suppl 4):iv426-70.
57. Crino L, Ahn M-J, De Marinis F, Groen HJM, Wakelee H, Hida T, et al. Multicenter phase
II study of whole-body and intracranial activity with ceri- tinib in patients with ALK- rearranged
non-small-cell lung cancer previously treated with chemotherapy and crizotinib: results from
ASCEND-2. J Clin Oncol (2016) 34(24):2866-73.
58. Felip E, Orlov S, Park K, Yu C-J, Tsai C-M, Nishio M, et al., editors. ASCEND-3: A Single-
Arm, Open-Label, Multicenter Phase II Study of Ceritinib in ALKI- Naive Adult Patients (pts) with
ALK-Rearranged (ALK+) Non-Small Cell Lung Cancer (NSCLC). Chicago, IL: ASCO (2015).
59. Gadgeel SM, Gandhi L, Riely GJ, Chiappori AA, West HL, Azada MC, et al. Safety and
activity of alectinib against systemic disease and brain metastases in patients with crizotinib-resistant
ALK-rearranged non-small-cell lung cancer (AF-002JG): results from the dose-finding portion of a
phase 1/2 study. Lancet Oncol (2014) 15(10):1119-28.
60. Ou SFI, Ahn JS, De Petris L, Govindan R, Yang JC, Hughes B, et al. Alectinib in crizotinib-
refractory ALK-rearranged non-small-cell lung cancer: a phase II global study. J Clin Oncol (2016)
34(7):661-8.
61. Shaw AT, Gandhi L, Gadgeel S, Riely GJ, Cetnar J, West H, et al. Alectinib in ALK- positive,
crizotinib-resistant, non-small-cell lung cancer: a single-group, multicentre, phase 2 trial. Lancet
Oncol (2016) 17(2):234-42.
62. Seto T, Kiura K, Nishio M, Nakagawa K, Maemondo M, Inoue A, et al. CH5424802
(RO5424802) for patients with ALK-rearranged advanced non- small-cell lung cancer (AF-OOIJP
study): a single-arm, open-label, phase 1-2 study. Lancet Oncol (2013) 14(7):590-8.
63. Nokihara H, Hida T, Kondo M, Kim YH, Azuma K, Seto T, et al., editors. Alectinib (ALC)
versus Crizotinib (CRZ) in ALK-Inhibitor Naive ALK-Positive Non-Small Cell Lung Cancer (ALK+
NSCLC): Primary Results from the J-ALEX Study. (Abstract 9008). Chicago, IL: 2016 ASCO
Annual Meeting (2016).
64. News Release FDA. FDA Approves New Oral Therapy to Treat ALK-Positive Lung Cancer.
(2017). Available from: http://www.fda.gov/NewsEvents/
Newsroom/PressAnnouncements/ucm476926.htm
65. Meijuan Li (2016) Statistical Methods for Clinical Validation of Follow-On Companion
Diagnostic Devices via an External Concordance Study, Statistics in Biopharmaceutical Research,
8:3, 355-363.
АНАЛИТИЧЕСКАЯ И КЛИНИЧЕСКАЯ ВАЛИДАЦИЯ
1. КЛИНИЧЕСКАЯ ВАЛИДАЦИЯ
Клинические исследования проводились с тестом О / RDx-LCCA с использованием тканей
FFPE с двумя видами рака (немелкоклеточный рак легкого и колоректальный рак).
Клиническая польза теста О / RDx-LCCA при обнаружении мутаций в соответствии с
предполагаемым использованием была продемонстрирована в двух клинических
исследованиях согласованности с использованием ранее одобренных FDA тестов в качестве
методов сравнения. Все исследования, основанные на подходе статистического тестирования
не меньшей эффективности (N1 - non-inferiority), соответствовали критериям приемлемости,
указанным в протоколе исследования. Соответствие, наблюдаемое между тестом О / RDx-
LCCA и одобренными сопутствующими диагностическими тестами, подтверждает
эффективность теста О / RDx-LCCA для выявления пациентов, опухоли которых
21
--- стр. 51 ---
fh
Ten (.» N C '() Reveal l)x I unu and ( (don ( ancer Assay
положительны no наличию мутаций в соответствии с предполагаемым использованием и
могут реагировать на соответствующие терапевтические препараты.
Критерии приемлемости Наблюдалось Пройден /
Не пройден
Клинические характеристики теста О / RDx-
LC C не должны быть хуже, чем у
согласованного диагностического теста,
одобренного FD A , с запасом не меньшей
эффективности не более 10%.
N SC LC : 4%
CR C: 5%
Пройден
2. Предел холостой пробы (LoB)
Предел холостой пробы (LoB), равный нулю, был определен для 72 независимых библиотек
образцов, приготовленных из четырех образцов FFPE, каждый из нормальной толстой кишки
и нормальной ткани легкого, с 4-6 повторами на образец, охватывающими низкий и высокий
ввод ДНК, две партии реагентов и три секвенирования. Не было сделано
ложноположительных наблюдений для клинически и аналитически значимых генов, и
никакие образцы или библиотеки не были исключены из анализа. Было подтверждено, что
каждый образец LoB был отрицательным для соматических вариантов, включенных в анализ
предела обнаружения (LoD). Результаты анализа LoB представлены в таблице ниже.
Показатель Наблюдаемое значение
Уровень ложноположительных результатов (FPR) 0%
Предел холостой пробы (LoB) 0
Критерии приемки Наблюдалось Пройден /Не
пройден
Порог вариантных результатов для
секвенированных областей должен быть
установлен таким образом, чтобы
соответствовать уровню
ложноположительных результатов <5%
(риск ошибки типа I а < 0,05).
Уровень ложноположительных
результатов (FPR) 0,01%
наблюдался во всех областях,
охваченных ONCO/Reveal Dx
Lung and Colon Cancer Assay.
Пройден
Частота ложно-положительных
срабатываний целевых вариантов
должна быть равна нулю.
Наблюдался уровень ложных
срабатываний 0%.
Пройден
3. ТОЧНОСТЬ
Соответствие ONCO/Reveal Dx Lung and Colon Cancer Assay оценивалось no способности
обнаруживать однонуклеотидные замены (SNV), короткие и средние делении с помощью
одного проверенного извне метода еравнения (Oneomine Foeus Assay).
Всего было протестировано 208 образцов (84 CRC и 124 NSCLC), 6 из которых дали
недействительные результаты с помощью проверенного метода сравнения NGS, а 2 - с
недействительными результатами с ONCO/Reveal Dx Lung and Colon Cancer Assay. Среди 200
действительных образцов 168 (84,0%) были идентифицированы как положительные по
крайней мере для одного варианта с помощью метода сравнения. Образцы включали простые
SNV, короткие и средние вставки, на которые нацелен ONCO/Reveal Dx Lung and Colon Cancer
Assay.
22
--- стр. 52 ---
Гсс( ()N C (>-Reveal I)x I .im y and t olon ( .meet As^ay
Совпадение данных клиничеекого исследования соответствия также считается демонстрацией
аналитической точности.
Критерии приемки Наблюдалось Пройден /Не пройден
Значения РРА и NPA для
всех вариантов в заявлении о
предполагаемом
использовании должны быть
равны или превыщать 95%.
РРА = 99,4% (96,8%, 99,9%)
и NPA = 100% (100%, 100%)
для всех вариантов в
заявлении о предполагаемом
использовании.
Пройден
Точность: Частота
необнаружения < 5%
Частота необнаружения =
Частота недействительных
результатов = 1%
Пройден
4. ПЕРЕКРЕСТНАЯ РЕАКТИВНОСТЬ
Анализ перекрестной реактивности in silico проводили для оценки специфичности праймеров,
используемых в анализе ONCO/Reveal Dx Lung and Colon Cancer Assay. Праймеры проверяли
на специфичность к геному человека и геномам типичных протозойных, вирусных, грибковых
и бактериальных патогенов человека. Всего 177 человеческих и 259 патогенных нецелевых
последовательностей с некоторым сходством с человеческим геномом были
идентифицированы с использованием in-silico ПЦР и анализа BLAST. Эти
последовательности были преобразованы в формат FASTQ и обработаны с помощью
программного обеспечения PiVAT. Тестовые образцы не произвели считывания на целевых
объектах и не выявили вариантных результатов для любой из нецелевых последовательностей,
в то время как получение ожидаемых вариантных результатов для положительных контролей,
включенных в анализ. Эти результаты продемонстрировали, что праймеры специфичны для
намеченных целевых последовательностей.
Критерии приемки Наблюдалось Пройден /Не пройден
Нецелевые области генома
человека должны не давать
целевых чтений.
Наблюдалось нулевое
количество целевых чтений с
использованием набора данных
теста генома человека
Пройден
Человеческие патогены,
присутствие которых можно
ожидать в пробах для анализа, не
должны давать целевых чтений.
Наблюдалось нулевое
количество целевых чтений с
использованием набора данных
по тестированию генома
патогенов человека
Пройден
5. ДОПУСТИМЫЕ ОТКЛОНЕНИЯ
Допуски, охватывающие этапы рабочего процесса подготовки библиотеки и секвенирования,
были оценены в соответствии с наиболее критическими этапами теста, которые могут
привести к сбою анализа. Каждый протестированный этап рабочего процесса включал 3
тестовых условия: низкое, номинальное, как определено инструкциями но применению, и
высокое. Диапазон допустимых отклонений для каждого исследования был разработан таким
образом, чтобы максимальная и минимальная контрольные точки вызывали проблемы с
системой, но при этом оставались в пределах диапазона эксплуатационных ощибок.
Были подготовлены 10 образцов ДНК FFPE и проанализированы в течение 4 прогонов
секвенирования для оценки этапов рабочего процесса подготовки библиотеки, таких как ввод
ПЦР и смещение температуры термоциклирования. Один эталонный стандарт ДНК был
подготовлен и проанализирован в течение 5 прогонов секвенирования для оценки этапов
23
--- стр. 53 ---
m и N t
Тест ( )N C '( )/Reveal l)x I une anti ( Olon ( .inter Assay
рабочего процесса секвенирования библиотеки, таких как концентрация библиотеки и
количество библиотек за цикл. Все исследования привели к нулю отказов и 100%
согласованию условий.
Выводы
Общий РРА = 100% и NPA = 100%. Результаты исследования допустимых отклонений не
выявили какого-либо влияния переменных процесса на эффективность анализа.
6. ПОВТОРЯЕМОСТЬ
Повторяемость оценивается в рамках исследования воспроизводимости.
7. ВОСПРОИЗВОДИМОСТЬ
Воспроизводимость ONCO/Reveal Dx Lung and Colon Cancer Assay оценивалась c
использованием в общей сложности панели из 10 образцов: 2 образца FFPE CRC с мутациями
KRAS (Glyl2Asp и Glyl3Asp), 1 образец FFPE CRC с мутацией BRAF (Val600Glu) и 2 образца
FFPE NSCLC с Мутацией EGFR (Glu746_Ser752delinsVal и Leu858Arg) были получены с
высокой и низкой частотой вариантов.
Исследование проводилось в трех лабораториях с 2 операторами в каждой лаборатории,
выполнявщими 3 цикла в разные дни. В каждой лаборатории использовали один прибор для
секвенирования и 2 партии реагентов. Каждый образец был протестирован в 4 повторах в
каждом прогоне, получив в общей сложности 36 возможных результатов (3 лаборатории X 3
прогона X 4 повтора).
Была рассчитана частота положительных результатов с двухсторонним доверительным
интервалом 95%. Частота положительных результатов для вариантов ДНК составила 100%
(90,4%, 100%) для всех протестированных образцов. Для каждого уровня образца / варианта
был проведен компонентный анализ вариации, чтобы оценить вариабельность анализа,
включая лабораторию, оператора, день (лаборатория, оператор) и повтор. Общие стандартные
Критерии приемки Наблюдалось Пройден /Не
пройден
Воспроизводимость
(общая): РРА и NPA
больще или равны 95%, а
нижняя граница 95%
доверительного
интервала больще или
равна 75%.
Воспроизводимость (общая) РРА =
100% (98,9%, 100%) и NPA = 100%
(100%, 100%).
Пройден
Повторяемость (по сайту):
РРА и NPA каждого сайта
больще или равны 95%, а
нижняя граница 95%
доверительного интервала
больще или равна 50%.
Повторяемость (по лаборатории)
РРА = 100% (96,9%, 100%) и NPA =
100%
(100%, 100%) для всех трех
оцениваемых лабораторий.
Пройден
Эквивалентность
термоциклера: такая же,
как повторяемость
Такая же, как повторяемость Пройден
24