Набор реагентов для определения мутаций 1100delC и IVS2 +1G>A в гене СНЕК2 методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени с детекцией кривых плавления (РеалБест-Генетика СНЕК2) по ТУ 21.20.23-065-23548172-2019 — инструкция и характеристики
Открытые закупки, где изделие проходит ТЗ
Сейчас открытых закупок, где изделие полностью проходит ТЗ, нет; список обновляется каждый день.
Построчная сверка ТЗ с характеристиками этого изделия и все закупки под ваши товары — в кабинете, 7 дней бесплатно.
Попробовать бесплатно
Текст инструкции: технические характеристики
--- стр. 1 --- «УТВЕРЖДАЮ» EeHepavibHbifi директор АО «Вектор-Бест» по применению набора реагентов для определения Ц мутаций 1 lOOdelC и IVS2 +1G>A в гене СНЕК2 методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени с детекцией кривых плавления «РеалБест-Генетика СНЕК2» ■ 'г 1. НАЗНАЧЕНИЕ Набор реагентов для определения мутаций 1 lOOdelC и IVS2 +1G>A в гене СНЕК2 ме тодом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени с детекцией кривых плав ления «РеалБест-Генетика СНЕК2» предназначен для качественного определения генотипов по мутациям ilOOdelC и 1VS2 +1G>A в гене СНЕК2, ассоциированных с риском развития рака молочной железы/рака яичников (РМЖ/РЯ), методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) в режиме реального времени с плавлением продуктов гибридизации с флуоресцентной меткой с последующим анализом кривых плавления. Набор может быть применён как вспо могательное средство диагностики при определения наследственных факторов риска разви тия РМЖ/РЯ и у пациентов с уже выявленным РМЖ/РЯ для уточнения разновидности рака (семейная форма, ассоциированная с мутацией гена СНЕК2). Набор может быть применён для образцов геномной ДНК человека, выделенной из цельной крови или буккального эпите лия. 2. ХАРАКТЕРИСТИКА НАБОРА 2.1. Принцип метода. Принцип метода основан на амплификации выбранного участка ДНК человека и по следующей детекции кривых плавления гибридных комплексов продуктов ПЦР и специфич ных зондов. Процесс амплификации заключается в повторяющихся циклах: температурная денатурация ДНК-матрицы, отжиг праймеров с комплементарными последовательностями ДНК-матрицы, синтез комплементарной цепи с этих праймеров Taq ДНК-полимеразой. Инструкция составлена сотрудниками АО «Вектор-Бест»: директором по производству Ткачевым В.К. и нач. отделения производства ПЦР наборов Трухиной А.В. --- стр. 2 --- После реакции амплификации понижение температуры приводит к гибридизации спе цифичного ДНК-зонда с продуктом амплификации и к снижению уровня флуоресцентного сигнала в пробирке. В процессе температурного плавления образовавшихся дуплексов про исходит высвобождение ДНК-зонда, несущего флуоресцентный краситель. В случае непол ной комплементарности ДНК-зонда и выбранного участка ДНК, температура плавления дуп лекса будет ниже, чем в случае полной комплементарности. Таким образом, для двух ал лельных вариантов температуры плавления дуплексов зонда и продуктов амплификации от личаются, благодаря этому идентифицируется генотип («нормальная гомозигота», «гетерозигота», «мутантная гомозигота»). 2.2. Состав набора: Компонент набора (сокращение) Описание. Количество Контрольный образец «Нормальная гомозигота» (KOI) Бесиветная жидкость, содержит натрия азид (0,05%) 1 пробирка, f! 1 мл Контрольный образец «Мутантная гомозигота» (К02) Бесцветная жидкость, содержит натрия азид (0,05%) 1 пробирка, 1 мл Готовая реакционная смесь для ПЦР (ГРС) Лиофилизированная 48 пробирок Элюирующий раствор «Генетика» Бесцветная жидкость 2фл., по 12 мл Оптическая пленка 1 лист Вкладыш с информацией о диапазонах температур плавления для KOI и К02 1 шт. г 2.3. Условия применения. , Аналитические и диагностические характеристики набора были валидироваяы при вы делении ДНК из клинических образцов (цельной крови, буккального эпителия) с использо ванием наборов реагентов «РеалБест-Генетика ДНК-экспресс» или «РеалБест экстракция 100», позволяющих получить концентрацию ДНК человека не менее 250 копий на реакцион ную пробирку (на 50 мкл препарата выделенной ДНК). | | Набор применяется с регистрирующими амплификаторами: «CFX96» (фирма «Bio- Rad», США); «ДТ-96», «ДТпрайм» (ООО «НПО ДНК-Технология», Россия). Набор реагентов рассчитан на проведение анализа 48 образцов, включая контрольные образцы. || 3. АНАЛИТИЧЕСКИЕ И ДИАГНОСТИЧЕСКИЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ 3.1. Специфичность набора «РеалБест-Генетика СНЕК2» по стандартному образцу предприятия (СОН 05-2-811), содержащему образцы с известными генотипами по мутациям 1 lOOdelC и IVS2 +1G>A в гене СНЕК2, определенными методом секвенирования по Сэнгеру, составляет 100 %. и --- стр. 3 --- л 3.2. Аналитическая чувствительность - минимальное количество ДНК человека, необ ходимое для нормальной работы набора, - 250 копий на реакционную пробирку (на 50 мкл препарата выделенной ДНК). * > 3.3. Аналитическая специфичность - для оценки аналитической специфичности был приведен in silico анализ последовательностей праймеров и зондов по базам последователь ностей потенциально перекрестно-реактивных вирусов и микроорганизмов, в том числе мик роорганизмов ротовой полости (Staphylococcus spp, Streptococcus spp, Prevotella spp, Lepto- trichia spp, Corynebacterium spp. Neisseria spp). Перекрестно реагирующих вирусов и микро- организмов обнаружено не было. 3.4. Диагностическая чувствительность: - в отношении мутации llOOdelC диагностическая чувствительность, вычисляемая как процент правильно определенных образцов с мутацией llOOdelC в гене СНЕК2, в клиниче ских испытаниях, проведенных на образцах от 15 пациентов, составила 100% (интервал 78,2- 100 %, с доверительной вероятностью 95 %). - в отношении мутации IVS2 +IG>A диагностическая чувствительность, вычисляемая как процент правильно определенных образцов с мутацией IVS2 +1G>A в гене СНЕК2, в клинических испытаниях, проведенных на образцах от 11 пациентов, составила 100% (ин тервал 71,5-100 %, с доверительной вероятностью 95 %). 3.5. Диагностическая специфичность: - в отношении мутации llOOdelC диагностическая специфичность, вычисляемая как процент правильно определенных образцов без мутации 1 lOOdelC в гене СНЕК2^ в клиниче ских испытаниях, проведенных на образцах от 222 пациентов, составила 100% (интервал 98.4- 100 %, с доверительной вероятностью 95 %). - в отношении мутации 1VS2 +1G>A диагностическая специфичность, вычисляемая как процент правильно определенных образцов без мутации IVS2 +1G>A в гене?СЯЖ2, в кли нических испытаниях, проведенных на образцах от 226 пациентов, составила 100% (интервал 98.4- 100 %, с доверительной вероятностью 95 %). 3.6. Воспроизводимость результатов качественного определения генотипов по мутаци ям 1 lOOdelC и IVS2 +1G>A в гене СНЕК2: клинические испытания, проведенные на 267 об разцах от 237 пациентов с использованием двух серий набора реагентов, показали 100 % межсерийную воспроизводимость результатов. При тестировании в двух независимых по становках двумя разными операторами на двух сериях набора образцов с разными генотипа ми в 10 повторах каждый внутрипостановочная, межпостановочная и межсерийная воспро изводимость результатов составила 100 %. --- стр. 10 --- »> гу рамки считывания, что в итоге выражается в синтезе усечённого белка с нарушенными функциями, как и в случае делеции llOOdelC. Для обеих этих мутаций показан «эффект ос нователя» в восточно-славянской популяции в Польше. Выявлена связь мутантных аллелей llOOdelC и IVS2 +Ю>А с раком молочной железы (РМЖ), раком щитовидной железы и раком простаты. Также повышенная частота мутаций в СНЕК2 выявлялась при миелодиспластическом синдроме, колоректальном раке, раке легко го, остеосаркоме, раке яичника (РЯ). Показано, что у носителей мутаций llOOdelC и 1VS2 + 1G>A, кроме увеличенного риска опухолеобразования, наблюдается также в среднем более раннее появление РМЖ и рака простаты, чем у лиц без этих мутаций. Носители мутации llOOdelC имеют значительно больший риск двустороннего поражения при РМЖ, чем паци енты без мутаций. Для носителей мутации СНЕК2 показана значительная ассоциация риска билатерального поражения после применения радиационной терапии первично диагностиро ванного РМЖ. Выявление мутаций в гене СНЕК2 для пациентов с раком простаты является фактором неблагоприятного прогноза, ассоциированным с повышенным риском раннего биохимического рецидива и метастатического прогрессирования заболевания после ради- ‘ t кального лечения и снижением выживаемости. Более подробно ознакомиться с диагностической значимостью определения генотипов по мутациям 1 lOOdelC и IVS2 +Ю>А в гене СНЕК2 можно в литературе: 1. Батенева Е.И., Филиппова М.Г., Тюляндина А.С., Мещеряков А.А., Жорданиа К.И., Грицай А.Н., Кадочникова В.В., Абрамов Д.Д., Рагимов А.А., Трофимов Д.Ю., Люб- ченко Л.Н. Высокая частота мутаций в генах BRCAI, BRCA2, СНЕК2, NBN, BLM у больных раком яичников в российской популяции. Опухоли женской репродуктивной системы. 2014;(4):51-56. 2. Воскресенский Д.А. Клинико-морфологические особенности больных раком молочной железы с врождённой мутацией в гене СНЕК2: автореф. Дисс. канд. Мед. Наук: 14.00.14, 03.00.04. - СПб., 2008, 25с. 3. Матвеев В.Б., Киричек А.А., Савинкова А.В. и др. Влияние герминальных му таций в гене СНЕК2 на выживаемость до биохимического рецидива и безметастатическую выживаемость после радикального лечения у больных раком предстательной железы. Онко урология 2018;14(4):53~67. 4. Прасолова М.А., Титов С.Е., Веряскина Ю.А. и др. Определение мутаций в ге нах СНЕК2 и NBS1 как маркеров наследственной предрасположенности к развитию онколо- гических заболеваний // Лаборатория ЛПУ. 2018. Спецвыпуск № 12. С. 39-44; 5. Соколенко А.П., Розанов М.Е., Митюшкина Н.В. и др. Наследственные мута ции при ранних, семейных и билатеральных формах рака молочной железы у пациенток из --- стр. 11 --- России // Сибирский онкологический журнал. 2008. Т. 27. № 3. С. 43-49. 6. Cybulski С., Gorski В., Huzarski Т. et al. СНЕК2 is а multiorgan cancer susceptibil ity gene // Am. J. Hum. Genet. 2004. V. 75. P. 1131-1135. 7. Weischer M., Bojesen S.E., Ellervik C. et al. CIiEK2*l lOOdelC genotyping for clinical assessment of breast cancer risk: meta-analyses of 26,000 patient cases and 27,000 controls // J Clin Oncol. 2008. V. 26. №. 4. P. 542-548. 9. УСЛОВИЯ ТРАНСПОРТИРОВАНИЯ, ХРАНЕНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ НАБОРА 9.1. Транспортировать изделия следует транспортом всех видов в крытых транспорт ных средствах в соответствии с правилами перевозок, действующими на транспорте данного вида, при температуре (2-8) ® С . Допускается транспортирование при температуре до 26 ® С не более 10 суток. 9.2. Хранение набора в упаковке предприятия-изготовителя должно осуществляться при температуре (2-8) °С в течение всего срока годности в холодильных камерах или холо дильниках, обеспечивающих регламентированный температурный режим с ежедневной ре гистрацией температуры. 9.3. Срок годности набора - 12 месяцев со дня выпуска. Не допускается применение наборов по истечении срока их годности. 9.4. Для получения надёжных результатов необходимо строгое соблюдение данной ин струкции по применению набора. 9.5. Изделие не требует технического обслуживания и не подлежит ремонту. 10. ГАРАНТИЙНЫЕ ОБЯЗАТЕЛЬСТВА 10.1. производитель гарантирует соответствие выпускаемых изделий требованиям нормативной и технической документации. > ,i : Безопасность и качество изделия гарантируются в течение всего срока годности. 10.2. Производитель отвечает за недостатки изделия, за исключением дефектов, воз никших вследствие нарушения правил пользования, условий транспортирования и хранения, либо действия третьих лиц, либо непреодолимой силы. 10.3. Производитель обязуется за свой счет заменить изделие, технические и функцио нальные характеристики (потребительские свойства) которого не соответствуют норматив ной и технической документации, если указанные недостатки явились следствием скрытого дефекта материалов или некачественного изготовления изделия производителем.■ f Срок годности набора - 12 месяцев со дня выпуска. --- стр. 12 --- II По вопросам, касающимся качества набора «РеалБест-Генетика СНЕ!^» следует об ращаться в АО «Вектор-Бест» по адресу: 630117, г. Новосибирск-117, а/я 492, тел. (383) 332-92-49, 227-60-30; тел./факс (383), 332-94-47, 332-94-44. E-mail: plkobtk(a).vector-best.ru Начальник отделения производства ПЦР-наборов АО «Вектор-Бест» А.В. Трухина Директор по производству АО «Вектор-Бест» Директор направления «Клинические исследования» ООО «Независимая лаборатория ИНВИТРО» Ткачев Овикова '* * 1fr