Набор реагентов для выявления и количественного определения ДНК Pseudomonas aeruginosa в клиническом материале методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с гибридизационно-флуоресцентной детекцией "АмплиСенс® Pseudomonas aeruginosa-скрин-титр-FL" по ТУ 9398-189-01897593-2012 — инструкция и характеристики

РУ: ФСР 2012/13997 от 29.10.2012 · класс риска 2б

Производитель: ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора (Россия)

Вид изделия: Pseudomonas aeruginosa нуклеиновая кислота ИВД, набор, анализ нуклеиновых кислот

В госконтрактах 44-ФЗ: 37 контрактов, медианная цена за единицу 9 648 ₽.

Автоматически отфильтрованный фрагмент инструкции по применению (страницы, где похоже, что есть таблица технических характеристик) — не полный документ. Карточка РУ на портале Росздравнадзора →

Текст инструкции: технические характеристики

--- стр. 3 ---
список СОКРАЩЕНИЙ
В настоящей инструкции применяются следующие сокращения и обозначения:
ВКО STI-87 - внутренний контрольный образец
К- - отрицательный контроль ПЦР
В- - отрицательный контроль экстракции
ОКО - отрицательный контрольный образец
П К - положительный контроль экстракции
ПКО - положительный контрольный образец
ПЦР - полимеразная цепная реакция
ФБУН ЦНИИ
Эпидемиологии
Роспотребнадзора
■  Федеральное бюджетное учреждение науки «Центральный 
научно-исследовательский институт эпидемиологии» 
Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав 
потребителей и благополучия человека__________________
Р.aeruginosa - Pseudomonas aeruginosa
НАЗНАЧЕНИЕ
Набор реагентов «АмплиСенс® Pseudomonas  аешдшоза-скрин-титр-РЬ»
предназначен для выявления и количественного определения ДНК Pseudomonas 
aeruginosa  в клиническом материале (кровь, плазма крови, мазок из ротоглотки,  
бронхоальвеолярный лаваж (БАЛ), мокрота, эндотрахеальный аспират, моча, секрет 
простаты, спинномозговая жидкость (СМЖ), пунктаты из очагов поражения органов и 
тканей) методом ПЦР с гибридизационно-флуоресцентной детекцией продуктов  
амплификации.
ВНИМАНИЕ! Результаты ПЦР-исследования учитываются в комплексной  
диагностике заболевания.^
ПРИНЦИП МЕТОДА
Выявление Pseudomonas aeruginosa  методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) 
с гибридизационно-флуоресцентной детекцией включает в себя три этапа;  
экстракцию ДНК из образцов кпинического материала, ПЦР-амплификацию участка  
ДНК данного микроорганизма и гибридизационно-флуоресцентную детекцию, которая  
производится непосредственно в ходе ПЦР (вариант FRT). Экстракция ДНК из  
клинического материала проводится в присутствии внутреннего контрольного образца 
(ВКО STI-87), который позволяет контролировать выполнение процедуры  
исследования для каждого образца. Затем с полученными пробами ДНК проводится  
реакция амплификации участка ДНК Pseudomonas aeruginosa  при помощи  
специфичных к этому участку ДНК праймеров и фермента Тад-полимеразы. В составе
^  в соответствии с Директивой Европейского Союза 98/79/ЕС.


--- стр. 4 ---
реакционной смеси присутствуют флуоресцентно-меченые олигонуклеотидные зонды, 
которые гибридизуются с комплементарным участком амплифицируемой ДНК-  
мишени, в результате чего происходит нарастание интенсивности флуоресценции.  
Это позволяет регистрировать накопление специфического продукта амплификации  
путем измерения интенсивности флуоресцентного сигнала. Детекция  
флуоресцентного сигнала осуществляется непосредственно в ходе ПЦР с помощью  
амплификатора с системой детекции флуоресцентного сигнала в режиме «реального 
времени».
В наборе реагентов применяется «горячий старт», что значительно снижает  
количество неспецифических реакций. «Горячий старт» обеспечивается  
использованием химически модифицированной Taq-полимеразы. Химически  
модифицированная полимераза (TaqF) активируется при прогреве реакционной  
смеси при 95 °С в течение 15 мин.
ФОРМАТЫ И ФОРМЫ ВЫПУСКА НАБОРА РЕАГЕНТОВ  
Набор реагентов выпускается в 1  формате.
Формат FRT
Набор реагентов выпускается в 3 формах комплектации:
Форма 1  включает комплекты реагентов «РИБО-преп» вариант 50, «ПЦР-комплекг»  
вариант FRT-50 F;
Форма 2 включает комплект реагентов «ПЦР-комплект» вариант FRT-50 F .
Форма 3 вкпючает наборы реагентов оптом, расфасованные по отдельным  
реагентам, с маркировкой реагентов на их оптовой фасовке. ^
Форма комплектации 1  предназначена для проведения полного ПЦР-  
исследования, включающего экстракцию и амплификацию ДНК Pseudomonas  
aeruginosa с гибридизационно-флуоресцентной детекцией в режиме «реального  
времени».
Форма комплектации 2 предназначена для проведения амплификации ДНК  
Pseudomonas aeruginosa  с гибридизационно-флуоресцентной детекцией в режиме  
«реального времени». Для проведения полного ПЦР-исследования необходимо  
использовать комплекты реагентов для экстракции ДНК, рекомендованные ФБУН  
ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора.
Форма комплектации 3 предназначена для производственных целей для  
последующей маркировки на языке заказчика и комплектации по наборам.


--- стр. 5 ---
ВНИМАНИЕ! Форма комплектации 3 используется только в соответствии с  
регламентом, утвержденным ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора.
АНАЛИТИЧЕСКИЕ ХАРАКТИСТИКИ 
Аналитическая чувствительность
Вид клинического  
материала
Комплект для  
экстракции  
ДНК
Комплект для  
амплификации  
и детекции
Аналитическая  
чувствитель­
ность, копий/мл
Линейный
диапазон
измерения,
копий/мл
■  Кровь, плазма 
крови, 
мазок из 
ротоглотки,
БАЛ,
мокрота,
эндотрахеальный
аспират,
моча,
секрет простаты,  
СМЖ,
пунктаты из 
очагов поражения  
органов и тканей
«РИБО-преп» «ПЦР-комплект»  
вариант FRT-50 F 500 8 0 0 - 
10 000 О О О
Аналитическая специфичность
Набор реагентов обнаруживает фрагмент ДНК Pseudomonas aeruginosa.  
Специфическая активность набора реагентов доказана при исследовании  
бактериальных штаммов Pseudomonas aeruginosa,  а также при исследовании  
клинического материала с последующим подтверждением результата методом  
секвенирования фрагментов амплификации.
Показано отсутствие активности компонентов набора в отношении ДНК-^угих  
бактериальных возбудителей {Enterobacter faecalis, Escherichia coli, IHaemophilus  
influenzae, Listeria monocitogenes. Neisseria meningitidis, Proteus vulgaris.  
Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus. Streptococcus pneumoniae,  
Streptococcus pyogenes  и др.), вирусов {Cytomegalovirus hominis, Herpes simplex virus  
I  и  II типа. Human herpes virus  6, 7 и 8 типа. Parvovirus  B19, Varicella-Zoster virus  и др.)
МЕРЫ ПРЕДОСТОРОЖНОСТИ
Работа должна проводиться в лаборатории, выполняющей молекулярно­
биологические (ПЦР) исследования клинического материала на наличие  
возбудителей инфекционных болезней, с соблюдением санитарно-эпидемических  
правил СП 1.3.2322-08 «Безопасность работы с микроорганизмами III-IV групп  
патогенности (опасности) и возбудителями паразитарных болезней», СанПиН


--- стр. 15 ---
ФО РМ А Т F R T
значения, а в таблице результатов по каналу для флуорофора FAM/Green  
определено значение порогового цикла Ct и расчетная концентрация больше  
указанного значения.
- Результат анализа невалидный, если для данной пробы не определено  
(отсутствует) значение порогового цикла Ct по каналу для флуорофора  
JOE/Yellow/HEX, и по каналу для флуорофора FAM/Green значение Cf также не  
определено (отсутствует) или расчетная концентрация меньше указанного  
значения. В этом случае требуется повторно провести ПЦР-исследование  
соответствующего клинического образца.
Линейный диапазон измерения набора реагентов; 800 -  10 000 000 копий/мл.  
Если результат больше, чем 10 000 000 копий/мл, то он выдается как результат  
более 10 000 000 копий/мл.  Если результат меньше, чем 800 копий/мл, то он  
выдается как результ ат  менее 800 копий/мл.
ВНИМАНИЕ! Граничные значения концентраций указаны во вкладыше, прилагаемом 
к набору реагентов данной серии.
Результат ПЦР-исследования считается достоверны м , если получены  
правильные результаты  для отрицательного и положительны х контролей  
амплиф икации, а также отрицательного и положительного контролей  
экстракции ДНК, в соответствии с таблицей оценки результатов контрольных  
реакций (см. табл. 2).
Таблица 2
Результаты для контролей различны х этапов ПЦР-исследовани1Г
Контроль
Контролируемый  
этап ПЦР-  
исследования
Результаты амплификации по каналу
FAM/Green JOE/Yellow/HEX
В - Экстракция ДНК Определено значение 
больше граничного
Определено значение 
меньше граничного
ПК Экстракция ДНК, 
ПЦР
Определено значение 
больше граничного
Значение укладывается 
в границы, указанные во 
вкладыше
К- ПЦР Значение отсутствует Значение отсутствует
К1 P.aeruginosa  
К2 P.aeruginosa ПЦР
Определено значение 
Ct и расчетная 
концентрация
Определено значение 
Ct и расчетная 
концентрация
ВНИМАНИЕ!
1 . Если для пробы получен невалидный результат, требуется повторить ПЦР-
исследование соответствующего клинического образца, начиная с этапа
1 5
i


--- стр. 16 ---
Ф О Р М А Т  F R T
экстракции.
2. Отсутствие положительного сигнала в калибраторах может свидетельствовать о  
неправильно выбранной программе амплификации и о других ошибках,  
допущенных на этапе постановки ПЦР. В таком случае необходимо провести ПЦР 
еще раз для всех образцов.
3. Если в отрицательном контроле экстракции (В-) по каналу JOEA'ellow/HEX  
определена концентрация больше указанного значения или для отрицательного  
контроля ПЦР (К-) по каналам FAM/Green и/или JOE/Yellow/HEX зафиксировано  
значение порогового цикла Ct, значит, произошла контаминация реактивов или  
проб. В этом случае результаты анализа по всем пробам считаются  
недействительными. Требуется повторить анализ проб, а также предпринять  
меры по выявлению источника контаминации.
4. Для исследуемого образца зафиксирован положительный результат, при этом на  
графике флуоресценции отсутствует участок характерного экспоненциального  
подъема (график представляет собой приблизительно прямую линию). Это может 
свидетельствовать о неправильно заданном уровне пороговой линии или  
параметров расчета базальной линии. Такой результат не должен рассматриваться 
как положительный. Если он получен при правильном уровне пороговой линии,  
требуется повторно провести ПЦР для этого образца.
1 6


--- стр. 17 ---
t :
СРОК г о д н о с т и . УСЛОВИЯ ТРАНСПОРТИРОВАНИЯ и ХРАНЕНИЯ  
Срок годности. 9 мес. Набор реагентов с истекшим сроком годности применению не 
подлежит. Срок годности вскрытых реагентов соответствует сроку годности,  
указанному на этикетках для невскрытых реагентов, если в инструкции не указано  
иное.
Транспортирование. Набор реагентов транспортировать при температуре от 2 до  
8 °С не более 5 сут. При получении разукомплектовать в соответствии с указанными 
температурами хранения.
Хранение. Набор реагентов хранить при температуре от 2 до 8 °С. ПЦР-смесь-1-FRT 
P.aeruginosa  хранить в защищенном от света месте. ПЦР-смесь-1-FRT Р.aeruginosa, 
ПЦР-смесь-2-FRT и полимеразу (TaqF) хранить при температуре не выше минус
16 °С.
Условия отпуска. Для лечебно-профилактических и санитарно-профилактических  
учреждений.
Рекламации на качество набора реагентов «АмплиСенс® Pseudomonas  
аегид/ло5а-скрин-титр-РЬ» направлять на предприятие-изготовитель ФБУН ЦНИИ  
Эпидемиологии Роспотребнадзора (111123 г. Москва, ул. Новогиреевская, д. За) в  
отдел по работе с рекламациями и организации обучения (тел. (495) 974-96-46, факс 
(495) 916-18-18, e-mail: products@pcr.ru)®.
Заведующий НПЛ ОМДиЭ
ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора
Е.Н. Родионова
Главный врач ФГВУ «Поликлиника № 1»
Управления делами Президента Российской Ф еде{^ии
^  Отзывы и  предложения о продукции «АмплиСенс» вы можете оставить, заполнив анкету  
потребителя на сайте: www.amplisens.ru.